邓禹攻击赤眉不利，刘秀命冯异率军西进，接替邓禹为西线主帅。延岑趁势收编了不愿降汉的小势力，兵马发展至七万。兵力得到补充的延岑觉得自己十分强大，高估了自己的势力，不但不避冯异锋芒，反而率军攻打，却被冯异一仗打回原型，远遁数百里，不敢再有任何造次。
后来赤眉断粮，欲返回家乡，延岑趁机占领了长安（今陕西省西安市境内）。可随着赤眉兵败，冯异大军折返，延岑再次被冯异击败，带领残部投靠秦丰。
秦丰对延岑十分器重，将自己的女儿嫁给延岑为妻。刘秀平定邓奉叛乱后，令岑彭攻打秦丰。延岑随秦丰出战，可眼见势头不对的延岑于战场之上留下秦丰自己跑了。
逃跑后的延岑一路入蜀，被公孙述封为汝宁王。
刘秀灭亡隗嚣后，公孙述看着汉军西路军大多都离开了西线，准备趁火打劫，命延岑率二十万大军入汉中（今陕西省汉中市境内），准备偷袭长安，却被汉军击退。
隗嚣败亡后，刘秀讨伐公孙述，延岑再次升起反叛之心，欲抗旨自立。在部将的劝说下，延岑方才率兵回师勤王，却被臧宫击败。
在公孙述灭亡的前夕，延岑建议公孙述组建“黑豹”特战营，虽然短期击败了吴汉，可终究因为汉蜀两军的实力硬差距，导致公孙述死于城下，蜀国灭亡。
延岑看到翻盘无望，又无处可逃，想着主动投降，能换来一条小命。可吴汉早就知道延岑是当时全国最大的反骨仔，留着必生祸端，于是将其斩杀。
建武十三年（公元36年），正月。
刘秀任命臧宫为广汉太守（今四川省德阳市境内），暂管益州事宜。
令大司马吴汉率领所部及马成部、刘隆部，携带公孙述龙袍、龙辇、龙椅等一切天子用器，及乐师、乐器、祭祀之物等一切国礼之物，乘坐楼船班师回朝。
路过南阳时（今河南省南阳市境内），刘秀命吴汉代替自己回故乡祭祖。
大军回洛阳后（今河南省洛阳市境内），刘秀亲率文武百官出城迎接。
平定了公孙述，扫除了刘秀最大也是最后一个心腹之患，至此全国范围内反叛势力也只剩下了个小小的卢芳。
想想十多年前，大哥刘演起兵之初曾定下的口号“复高祖之业，定万世之秋”，经过这十多年的浴血奋战，不知有多少艰难，多少险阻，如今终于算是即将完成。
想着国家即将归为一统，刘秀站在大殿之前，俯瞰着这万里河山，如梦如幻。
刘秀回到殿中，独自一人盯着最近绘制的大汉地图，心中无限波澜。
为了这宏图伟业，多少至亲付出了生命的代价。
大哥刘演。
二哥刘仲。
大姐夫田牧。
二姐刘元。
族兄刘稷。
骁骑大将军刘植。
心腹智囊苗萌。
建义大将军万修。
车骑大将军景丹。
征虏大将军祭遵。
义薄云天倾囊相助的铁源。
征西大将军冯异。
表兄来歙。
征南大将军岑彭。
还有那数十万战死沙场的汉军将士。
想到这里，刘秀潸然泪下。
正是由于这些英烈奋不畏死，前赴后继，化作一笔笔浓墨，才让这张地图看起来如此的雄伟、壮阔。
十日后，刘秀下旨，大封有功之臣。
封孔子嫡脉后人孔安为宋公。
封周文王嫡脉后人姬常为卫公。
天下大定，民心向汉，刘秀诏凉州牧窦融入京。
窦融接到刘秀的诏书，坐立难安，害怕刘秀卸磨杀驴，自己落得个兔死狗烹的下场。
史苞对窦融说：“自古帝王多疑心，不过是臣下的权力太大，使帝王感觉到了威胁。将军既然无意自立，何不来个以退为进？将军这次入朝，就将所有家小一同带上，见到陛下后，就向陛下辞去凉州牧，陛下必会对将军放心。再加上陛下素来仁德，就算同意了将军辞去凉州牧，也定会委以其他重任。只要将军把兵权交出去，以将军的功劳，那还不是享尽一世荣华富贵？”
窦融思索一夜，决定听从史苞的建议。
一切妥当之后，窦融带领全部家小，及五郡太守：武威郡太守梁统（今甘肃省武威市境内），张掖郡太守史苞（今甘肃省张掖市境内），酒泉郡太守辛彤（今甘肃省酒泉市境内），敦煌郡太守竺曾（今甘肃省酒泉市境内），金城郡太守库钧（今甘肃省兰州市境内）。还有大量门客，乘坐马车千余辆，赶着牛羊十余万，抵达洛阳。
刘秀于洛阳西郊率百官迎接窦融。
窦融拜见过刘秀后，主动交上凉州牧印绶。
刘秀将凉州牧印绶放回窦融手里，对窦融说：“窦周公，你这是做什么？朕当初和你第一次相见的时候就对你说过，朕要让你为朕世代守卫河西，如今你为朕守河西，以后你的儿子要为朕的儿子守河西，你我君臣，世世代代永不相负。如今你带领全部家小入京，还要主动辞去凉州牧，难不成你把朕想成忘恩负义的小人了？”
窦融连忙说：“臣岂敢如此想陛下，当日臣就说过，臣祖上是文帝之妻窦后，窦家世代效忠大汉，臣自然也愿为陛下效死。可臣年龄大了，征战了半生，也想过几天舒坦日子，臣不求别的，只想让陛下在这洛阳给臣赐一座大宅院，再赐上几千亩良田，也让臣好好享受享受这京城的繁华。”
刘秀说：“朕知道你怎么想的，你是害怕朕对你不放心。也罢，与其让你整日担惊受怕，坐立难安，不如朕就将凉州牧收回。可你别也想着在洛阳躲清闲，这样，正好冀州牧的位置尚且空着（今河北省中南部地区），朕就封你为冀州牧。你能把西北治理的如此好，也一定能把冀州治理好。”