就在楚青天、柳念与灰鸮在翡翠三角洲的雨林深处，为了生存而艰难挣扎的同时，一场针对黑曜石集团东南亚总部的、代号“净世”的全面剿灭行动，正以雷霆万钧之势，在广袤的东南亚群岛与半岛间同步展开。
这场行动的力量构成远比针对国内分部的“根除”行动更加复杂和庞大。主导者依然是“星火同盟”，他们凭借从“蓬莱”核心数据库（在柳念与“主脑”最终对抗时，灰鸮冒险截留并发送出去的碎片数据）中获取的最高机密——包括东南亚各分部的精确坐标、防御体系详图、人员配置、乃至部分高层人员的生物识别码和隐秘通讯频率——制定出了精准到可怕的打击方案。
但这一次，“星火同盟”不再是孤军奋战。
楚青天三人从“蓬莱”内部传出的、关于“归墟协议”和“摇篮”的终极威胁，如同最后的警钟，终于撼动了某些一直持观望态度、或者与黑曜石\/天穹科技存在利益纠葛的国际势力和地区强国。当确凿的证据表明，黑曜石的疯狂计划并非局限于某个国家或地区，而是旨在进行一场无差别的“生态净化”，将整个星球拖入深渊时，沉默便不再是可行的选项。
于是，在“净世”行动的指挥中心——一个位于某中立国地下深处的、高度保密的联合指挥部内，出现了多股力量的影子：有来自北方大国的特种作战顾问与信息战专家，他们提供了关键的轨道威慑（那险些落下的打击正是他们的“劝降”手段）和强大的电子压制能力；有来自周边几个深受黑曜石渗透之苦的国家的精锐特战队，他们熟悉本地环境，负责地面引导和清扫；甚至还有一些原本与黑曜石存在灰色合作的跨国财团，在权衡利弊后，选择了“弃暗投明”，提供了内部通道和资金支持。
这是一场奇特的、暂时摒弃了前嫌的联盟，目标只有一个：彻底铲除黑曜石这个已然失控的、威胁全人类的毒瘤。
第一目标：苏门答腊，代号“雨林母巢”的生化武器研发与生产基地。
此地隐藏于一片受保护的原始雨林国家公园地下，伪装成生态研究站。打击在拂晓前发动。首先是由北方大国提供的、经过特殊改装的“幽灵”无人机群，它们如同无形的死神，悄无声息地瘫痪了分部外围的所有主动防御系统和通讯阵列，释放出针对其生物哨戒的特殊频段干扰波。
紧接着，数架低噪音运输直升机在夜色的掩护下，将多支由“星火同盟”和当地特战队混编的突击队，精准投送至几个关键的通风管道入口和紧急出口附近。队员们穿着全封闭式防化服，装备着针对生化环境优化的武器。他们利用获取的权限密码和生物识别伪造信息，如同手术刀般切入基地内部。
战斗在幽闭、布满培养罐和变异生物的通道内激烈展开。黑曜石的守卫大多是经过基因强化的“丛林猎杀者”，但在早有准备、装备精良且配合默契的突击队面前，节节败退。突击队的首要目标是位于基地最深处的“病原体核心库”和“主控实验室”。他们遭遇了激烈的抵抗，甚至触发了部分区域的自我毁灭程序，释放了致命的神经毒气。但在付出一定代价后，核心区域被成功占领，所有高危病原体样本和研究数据被就地封存或销毁，主要研究人员非死即俘。“雨林母巢”在冲天的大火和内部的连环爆炸中，化为一片废墟。
第二目标：湄公河三角洲，代号“金融触手”的数据处理与资金调度中心。
这个分部伪装成一家位于河畔高档写字楼内的国际投资公司。打击方式更为隐秘和数字化。在统一行动时间，联合指挥部的信息战单位发动了总攻。通过灰鸮提供的后门和漏洞，他们如同潮水般涌入“金融触手”的网络系统，冻结了其所有的资金流动，篡改了大量交易记录，并将其与黑曜石全球其他节点的数据连接强行切断。
几乎同时，当地警方和金融监管机构（已被说服或施加压力）以“涉嫌跨国洗钱和非法数据交易”为名，公开进入大楼进行搜查。内外交困之下，“金融触手”分部的负责人试图销毁核心服务器，却被内部早已被策反的安保主管带领的“星火”内应控制。大量的金融犯罪证据和黑曜石全球资金往来记录被完整缴获，这颗为黑曜石输送血液的心脏被瞬间摘除。
第三目标：马六甲海峡，代号“深港”的物流枢纽与隐秘船坞。
这里是黑曜石进行非法物资运输、人员转移以及某些大型实验设备海上测试的关键节点。打击动用了海军力量。两艘隶属于某合作国家的、以反潜和封锁见长的护卫舰，在行动开始后，迅速封锁了“深港”所在海域。一支海军陆战队特种小队，乘坐高速突击艇，在舰炮的火力掩护下，强行登陆了那座伪装成废弃码头的船坞设施。
这里的抵抗异常顽强，守卫多是经验丰富的退役特种兵和亡命之徒，依托坚固的工事和重火力进行顽抗。战斗从码头延伸到仓库，再深入到地下船坞，异常惨烈。最终，在护卫舰发射的精确制导导弹摧毁了码头的主要防御工事后，特种小队才得以突入核心区域，控制了仍在船坞中进行改装的一艘具备潜航功能的特种运输船，并俘获了大量往来物资的清单和航运记录。“深港”在激烈的交火和爆炸中，沉入燃烧的海水。
第四目标至第七目标 也以类似的方式，在几乎同一时间遭遇毁灭性打击：
· 菲律宾群岛，代号“火山口”的能量武器试验场，被远程精准火力覆盖和特种部队突袭相结合的方式摧毁，部分未稳定的能量核心泄露，引发了小范围的地质扰动。
· 缅甸丛林，代号“蛇窟”的私人武装训练营，在遭受高强度空袭后，被数量占优的当地政府军和“星火”雇佣兵联手清剿。
· 泰国湾，代号“珊瑚”的水下科研站（实为深海基因采集与克隆前哨），被特种深潜器和智能水雷联合绞杀，设施内部自毁系统启动，与部分危险实验体一同葬身海底。
· 新加坡，代号“镜厅”的情报中转与渗透指挥部，在信息战和内部策反的双重打击下，其网络被彻底瓦解，核心成员在试图搭乘私人飞机逃离时被拦截逮捕。
第八目标：爪哇岛，代号“圣堂”的“基石”次级共鸣站与“主脑”备用服务器阵列所在地。
这是除“蓬莱”外，黑曜石在东南亚最重要、防御也最严密的据点，甚至在一定程度上共享“蓬莱”的部分“基石”能量。这里的战斗最为诡异和凶险。
打击开始前，联合指挥部监测到“圣堂”内部爆发出极其不稳定的、类似“基石”能量的剧烈波动——显然是“蓬莱”崩溃和“主脑”受创的连锁反应。当多国特种部队和“星火”精英利用获取的权限突入时，他们看到的并非严阵以待的守卫，而是一片……混乱的噩梦。
能量过载导致部分“基石”共鸣设备失控，散发出扭曲现实的力场，一些区域的重力异常，一些通道在不断地自我复制和错位。更可怕的是，那些深度依赖“基石”能量维持的守卫和研究人员，很多出现了可怕的变异或精神崩溃，有的身体溶解成了半能量的粘稠物质，有的则彻底疯狂，无差别地攻击所见的一切活物。
这里已经不再是军事目标，更像是一个正在坠入异次元的、活着的炼狱。突击部队不得不一边与疯狂的变异体、失控的能量场作战，一边艰难地向核心服务器阵列推进。最终，在付出了惨重代价后，他们成功安装了高能炸药，将“圣堂”连同其内部所有的疯狂与秘密，一同炸回了基本粒子状态。
最终目标：“蓬莱”本部及其周边残余力量的清理。
虽然“蓬莱”核心已因楚青天他们的行动而崩溃，但其庞大的地下结构外围，以及分布在周边雨林中的一些支援设施、警戒哨所和逃亡人员，依然需要肃清。这部分工作主要由“星火同盟”的后续部队和合作国家的陆军单位完成，他们像梳子一样梳理着“蓬莱”周边的雨林，清剿残敌，确保没有任何漏网之鱼能将“基石”或“摇篮”的技术碎片带出去。
“净世”行动持续了整整四十八小时。
当最后一份“目标清除”的报告传回联合指挥部时，巨大的电子沙盘上，代表黑曜石东南亚总部及其所有重要分支的红色光点，已全部熄灭。
曾经盘踞在东南亚阴影之中，触手遍及军政商科各界，野心勃勃试图开启“归墟”时代的黑曜石集团，其核心力量在短短两天内，遭受了近乎毁灭性的打击。其主要分部被连根拔起，核心研究人员或死或俘，积累了数十年的研究数据和资源或被销毁或被缴获，庞大的网络和资金链被彻底斩断。
然而，指挥部内的气氛并未完全放松。所有人都清楚，像黑曜石这样的组织，不可能没有最后的逃生手段和隐藏更深的“休眠细胞”。那个“主脑”的意识，是否真的随着“蓬莱”和“圣堂”的毁灭而彻底消失？那些散布在世界各地、未曾暴露的中低层人员和技术储备，是否会死灰复燃？
更重要的是，那三个以近乎传奇的方式，从内部引爆了这场最终毁灭的关键人物——楚青天、柳念、灰鸮——他们现在何处？是生是死？
联合指挥部下达了最后一道命令：继续搜寻黑曜石可能存在的残余势力和技术泄露，同时……尽全力寻找那三个人的下落。他们不仅是英雄，更是可能携带着关于“基石”、“摇篮”以及“主脑”最终秘密的、唯一的活字典。
而在遥远的、通讯断绝的翡翠三角洲深处，对这一切尚且一无所知的楚青天三人，正拖着沉重的担架，迎着初升的朝阳，踏入了那片更加幽深、更加未知的雨林。
他们的战斗似乎结束了，但他们的旅程，以及整个世界因黑曜石覆灭而掀起的新的波澜，才刚刚开始。