我们要探究秦始皇身世之谜，必然是以西汉史学家司马迁的《史记》为依据。作为中国第一部纪传体通史，《史记》被誉为“史家之绝唱，无韵之离骚”，其在众多历史典籍中的权威性，是毋庸置疑的，但是令人疑惑的是，关于嬴政的生父是谁，作者司马迁给出了两种答案。
在《史记·吕不韦列传》中，司马迁记载了这样一段文字：
“吕不韦取邯郸诸姬绝好善舞者与居，知有身。子楚从不韦饮，见而说之，因起为寿，请之。吕不韦怒，念业已破家为子楚，欲以钓奇，乃遂献其姬。姬自匿有身，至大期时，生子政。子楚遂立姬为夫人。”
这段话的白话意思是：吕不韦在邯郸娶了一位容貌绝美、擅长跳舞的女子（即后来的赵姬）与他同居，并且知道她已经怀孕。有一次，子楚来吕不韦家赴宴，见到赵姬后十分喜爱，便起身敬酒，请求吕不韦把赵姬赐给自己。吕不韦起初很生气，但转念一想，自己已经为子楚散尽家产，本意就是要做一场“政治投机”，于是就顺水推舟把赵姬献给了子楚。赵姬隐瞒了自己怀孕的事，生下了儿子嬴政。子楚随后就立赵姬为夫人。
而在《史记·秦始皇本纪》中，却是截然不同的说法，此篇说这样记载的：
“秦始皇帝者，秦庄襄王子也。庄襄王为秦质子于赵，见吕不韦姬，悦而取之，生始皇。以秦昭王四十八年正月生于邯郸。及生，名为政。”
这段话的白话意思是：秦始皇是秦庄襄王（子楚）的儿子。庄襄王当年在赵国做质子时，见到了吕不韦的姬妾（赵姬），心生喜爱便娶了她，之后生下了始皇。始皇在秦昭王四十八年（公元前259年）正月出生于邯郸，出生后取名为政。
同一部《史记》为何会有这样的矛盾呢？我是这样推断的：司马迁作为汉代史官，他既要记录秦国官方认可的“正统叙事”（《秦始皇本纪》），又要收录流传于民间、带有六国遗民情感色彩的“野史传说”（《吕不韦列传》）。这种“兼收并蓄”本是为了尊重历史，却意外让这场身世之争成了千年悬案。
其实我们探究历史，就会发现“吕不韦献有孕之姬”这种说法有几个无法自圆其说的漏洞：
其一：吕不韦是中国历史上最顶级的“政治投资人”，他的投资计划是通过扶持子楚登上王位，换取自己的权倾天下。这种投资逻辑是成立的，只要子楚成为秦王，他作为“首功之臣”，必然获得权势与富贵。而“献有孕之姬”的行为，却是一场疯狂的赌博。
我们来分析一下，战国时期没有现代验孕技术，吕不韦无法保证胎儿是男孩，若赵姬嫁给子楚后生下女儿，吕不韦的计划就会破产。
其次是一旦子楚或秦国王室发现真相，这便是“欺君罔上”“玷污宗室”的滔天大罪。吕不韦的前期投资不仅会前功尽弃，还会被灭族；赵姬母子也会被立刻处死。对于一个已为子楚“破家”的投资人而言，这种“赌上全族性命”的操作，完全是违背常理的。
再说，即便他都孩子顺利出生且为男孩，以后也未必一定能继承王位。吕不韦真正的政治筹码，是“帮助子楚成为太子嗣”的功劳。事实上，子楚能被立为继承人，关键是吕不韦说动了秦孝文王的王后华阳夫人，让她认子楚为“养子”，从而获得“嫡子”身份。扶持子楚才是“稳赚不赔”的正确投资，吕不韦没必要舍近求远，去冒灭族之险。
其二：秦国自商鞅变法后，建立了极其严密的官僚与宗室制度，“王位继承”作为国之根本，更是有着严格的审查流程。
首先是后妃入宫的“身份核查” 。赵姬作为子楚的夫人，其出身、健康状况，都会经过秦国王室的审查。若她当时已有身孕，很难逃过医官与女官的眼睛。
其次是怀孕生产的“全程记录” 。秦国宫廷对后妃的“受孕时间”“胎动情况”“生产日期”都有详细记录，这些记录会存档于“宗正府”（掌管宗室事务的机构），作为王位继承的凭证。若嬴政的出生日期与“受孕时间”不符，必然会被宗室质疑秦国王室绝不会允许一个“非嬴姓血脉”的孩子继承王位。
那为什么“吕不韦生父说”在逻辑上漏洞百出，为何却广为流传呢？
首先，秦朝统一六国的过程，充满了血腥与暴力：长平之战坑杀赵卒四十万，灭韩、赵、魏时“尽迁其民”，灭楚时“斩首十万”，这些仇恨，在秦朝灭亡后，转化为六国遗民的“舆论报复”。
一方面，若嬴政是吕不韦之子，那么他就不是“嬴姓正统”，秦国的王位本质是“吕氏窃取”，秦朝的“统一”也就失去了合法性；另一方面，将秦始皇描绘成“商人的私生子”，可以彻底贬低他的身份，从“千古一帝”沦为“阴谋的产物”，从“天命所归”沦为“龌龊骗局”，以此消解他统一中国的历史功绩，慰藉六国被灭的屈辱。
西汉初年，楚地流传的《楚歌》中，便有“吕政（即嬴政）无道，残贼天下”的歌词，歌中直接把嬴政称为“吕政”，可见“吕不韦生父说”在六国遗民中已成为共识。
另一方面，古代皇帝自称天子，统治天下是天命所归，汉朝取代秦朝后，面临一个问题：就是如何证明自己“得国之正”？答案是“否定秦朝的合法性”，只有证明了秦朝的“无道”“失德”“得国不正”，汉朝的“取而代之”才是“顺天应人”。
据史书记载，汉高祖刘邦曾称秦始皇“政由吕出，天下谓之吕政，政不当立”，将“嬴政非嬴姓”作为秦朝“失德”的证据之一。
司马迁作为汉代史官，虽然秉持“究天人之际，通古今之变”的治史态度，但也无法完全摆脱官方立场的影响。他将“吕不韦生父说”收录于《史记》，并非认可其真实性，而是将其作为“秦朝失德”的佐证之，间接强化汉朝“代秦有理”的正统性。
我们再从吃瓜群众的角度来说，相比于《秦始皇本纪》中“庄襄王之子”的枯燥记载，“吕不韦献姬”的故事显然更具传播力：它包含了“巨富权臣”“绝色美人”“宫廷阴谋”“私生子逆袭”等所有符合猎奇心理的元素。
在口耳相传的过程中，故事被不断“细节化”：有人添油加醋地描述赵姬的“美貌”，有人夸张吕不韦的“权谋”，有人渲染子楚的“愚蠢”——原本模糊的传说，逐渐变得“有鼻子有眼”，最终被当成“真实历史”流传下来。
这种“流言战胜正史”的现象，在历史上并不罕见：人们往往更愿意相信“精彩的谎言”，而非“平淡的真相”。
随着史学研究的深入，现代秦汉史学者（如李开元、王子今、辛德勇等）通过对史料的交叉验证与逻辑推理，已形成高度共识：秦始皇嬴政的生父，必然是秦庄襄王子楚。
在《史记》一书中，《本纪》是记载帝王正统生平的核心篇章，其史料来源多为官方档案，权威性极高；而《列传》则更侧重人物的轶事与传说，史料来源包括民间口述、诸子杂说等，严谨性远逊于《本纪》。当两者冲突时，应以《本纪》的记载为准，这是史学研究的基本准则。
另外，在另一部重量级史书《战国策》，对吕不韦帮助子楚登上王位的过程记载极为详细：从“邯郸见子楚”到“西入秦说华阳夫人”，再到“子楚立为太子嗣”，每一步都有具体的对话与策略，却完全没有提及“献有孕之姬”的情节。
《战国策》的编纂者以“记录权谋”为核心目的，若“吕不韦换子”确有其事，这无疑是“战国第一权谋”，必然会被大书特书，但书中一字未提，这只能说明：在秦汉之际，“吕不韦生父说”要么尚未流传，要么被认为是毫无根据的谣言。
结合所有史料与逻辑推理，我们可以还原出最接近真相的历史原貌：
公元前262年，子楚（异人）作为秦国质子居于邯郸，与吕不韦结识，吕不韦认定其“奇货可居”，开始为其谋划登基为王之事；
公元前261年左右，子楚在吕不韦府中见到赵姬，心生喜爱，吕不韦将赵姬献给子楚（此时赵姬未怀孕）；
公元前260年，赵姬怀孕（受孕于子楚）；
公元前259年正月，赵姬在邯郸足月生下嬴政；
公元前257年，秦赵爆发长平之战后，子楚在吕不韦帮助下逃回秦国，赵姬与嬴政被藏匿在赵国；
公元前251年，秦昭王去世，子楚之父秦孝文王继位，子楚被立为太子，赵姬与嬴政被接回秦国；
公元前250年，秦孝文王去世，子楚继位（秦庄襄王），立嬴政为太子；
公元前247年，秦庄襄王去世，嬴政继位为秦王。
这条时间线完全符合《秦始皇本纪》的记载，也与《战国策》中吕不韦的政治布局相吻合，更不存在任何逻辑矛盾——这才是历史的真相。