修仙界于暗影傀儡之劫后，残垣断壁处处，修士与百姓齐心重建。然林凡心中，阴影未散，那黑袍人临终所言混沌星族残部，如芒在背。
这日，林凡于灵源阁密室参详混沌灵珠。灵珠忽绽微光，牵引其神识入一奇异空间。内里混沌雾霭翻涌，似藏无尽奥秘。待雾霭稍散，林凡惊见一幅幅画面闪过：远古之时，混沌星族盛极一时，掌控超凡星力与混沌秘法，其野心膨胀，妄图主宰诸界，遂挑起一场旷古大战。修仙界先辈们奋起反抗，以巨大牺牲将混沌星族封印于异次元空间，混沌灵珠便是封印关键。然岁月悠悠，封印渐弱，混沌星族残部暗中谋划破封，与修仙界叛徒勾结，妄图借傀儡之乱颠覆修仙界，为全面复出铺路。
林凡自灵珠空间退出，满脸凝重。此危机远非想象中那般简单，仅凭修仙界之力，恐难彻底抵御混沌星族复出。沉思良久，林凡决定远赴灵虚仙境，求见灵虚仙尊。此仙境位于时空乱流深处，神秘莫测，仙尊更是深居简出、法力无边，然其对诸界安危向来看重。
林凡孤身踏上征程，穿越重重空间风暴与危险秘境。途中，遇一奇异空间裂缝，从中溢出丝丝混沌气息，似有某种未知存在窥探。林凡警觉，周身混沌之力护体，小心翼翼穿越。
历经艰险，终抵灵虚仙境。但见仙境中奇花异草芬芳，灵泉飞瀑倒挂，仙禽瑞兽嬉闹，云雾缭绕间宫殿若隐若现。林凡表明来意，守境童子引其入内。
灵虚仙尊高坐莲台，周身仙气氤氲，目光深邃如星。林凡详述混沌星族之事，仙尊微微皱眉：“混沌星族野心不死，此劫关乎诸界存亡。吾虽久不问世事，然亦不能坐视。”仙尊思索片刻，又道：“欲破混沌星族阴谋，需集诸界之力。吾知有一灵界，与修仙界相邻，灵族天生掌控灵力，若能得他们相助，胜算大增。然灵界与修仙界通道被毁已久，需寻修复之法。”
林凡心中一喜，忙请教修复通道之策。仙尊长袖一挥，一道灵光入林凡脑海，乃是修复通道之法与灵界信物。林凡拜谢仙尊，匆匆返回修仙界。
归途中，那股混沌气息再现，且更为浓烈。突然，一群身着星纹黑袍、散发诡异光芒的星族战士自混沌中杀出，个个气息强大，招式凌厉。林凡不敢怠慢，混沌神枪入手，枪芒如电，与星族战士激战。星族战士施展出奇异星力法术，化作璀璨星光利刃，铺天盖地斩向林凡。林凡运转混沌之力，身形如电，枪尖轻点，化解攻势。一番苦斗，林凡虽斩杀数名星族战士，但对方人多势众，且援兵不绝。
危急时刻，林凡想起灵虚仙尊所授秘法，强行凝聚灵力，施展出混沌破界一击。强大力量瞬间爆发，将星族战士击退，趁机脱身。
回到修仙界，林凡召集各方高手，言明跨界求援之事。众人皆赞同，齐心协力寻找修复通道之物。林凡则根据灵虚仙尊指示，前往修仙界古老遗迹——星耀古殿。传说此殿乃远古仙人与星界沟通之所，留存星界之力与诸多宝物。
古殿中机关重重，陷阱密布。林凡率队小心翼翼前行，破解一道道符文禁制，击退守护傀儡。终在古殿深处寻得星界核心碎片与灵界通道基石。
与此同时，修仙界其他修士亦在各地寻觅材料，丹修以珍稀灵草炼制特殊丹药，增强修士体质与灵力储备；剑修于灵脉汇聚之地闭关参悟更强剑意；符修绘制超级防御与攻击符咒。
林凡携众人搜集之物，选定修仙界与灵界边界之地，开始修复通道。众修士各施其能，灵力光芒照亮天际。然修复过程中，混沌星族察觉意图，遣来大批星族强者与黑暗傀儡破坏。
林凡指挥修士们布阵迎敌，剑修剑阵纵横，符修符咒纷飞，丹修丹药补给。林凡则独身冲入敌阵，混沌神枪所到之处，星族强者与傀儡纷纷溃败。但星族攻势不绝，通道修复进度受阻。
此时，灵界感应到通道修复之事与修仙界危机，灵族族长亲率精锐部队，穿越尚不稳定之临时通道前来支援。灵族战士浑身散发柔和灵芒，其灵力与修仙界灵力融合，威力大增。
林凡与灵族族长携手，制定新战略。先由灵族施展灵界秘法，稳定通道并强化周边防御，再由修仙界修士集中力量攻击混沌星族主力。
战斗激烈展开，灵族灵力化作护盾与治愈光团，护佑众修士；修仙界修士则全力施为，攻击犀利。林凡与灵族族长联手对抗混沌星族首领，一场惊世大战，天地失色，空间破碎。
最终，凭借两界齐心合力，混沌星族主力溃败，通道修复完成。然危机尚未彻底解除，混沌星族残部仍在暗处谋划。林凡与灵族族长约定，此后两界加强合作交流，共同守望诸界和平，为即将到来的最终决战持续准备。