永恒新生圣殿的重生灵韵在万象记忆星海流转，宇宙深处却传来诡异的“虚空低语”。无界医盟的量子共振监测器捕捉到异常波动，一种名为“溯源暗流”的幽蓝色能量自宇宙诞生之初的奇点残骸中迸发，所到之处，物质开始逆向分解为基本粒子，文明的科技产物退化成原始形态，就连生命体的基因链也在回溯至最初的编码状态。这场危机不仅威胁现存秩序，更试图将宇宙拖回创世前的虚无。
秦溯在青山村为新生的希望树苗浇水时，水壶突然变成粗陶瓦罐，水流化作原始清泉。永恒新生圣殿的记忆能量装置开始逆向运转，石碑上的文字逐渐褪成创世之初的神秘符号。初代神农的虚影裹挟着远古气息浮现，手中捧着半块布满星纹的陨石：“溯源暗流非文明的终结，而是探寻本源的密钥。当一切归于初始，唯有以万生的存续执念为引，方能揭开宇宙诞生的终极谜题。”与此同时，秦曦的实验室里，精密仪器退化为青铜器，实验数据转化成岩壁上的古老图腾。
循着紊乱的能量波动，探索小队踏入宇宙边缘的“原初裂隙”。这里悬浮着无数发光的时空胚胎，每个胚胎都蕴含着宇宙诞生瞬间的记忆残片：夸克在高温中狂舞、暗物质与暗能量的初次碰撞、第一缕光子的诞生。裂隙中央，一座由混沌物质与原始法则碎片堆砌而成的“虚无祭坛”缓缓升起，坛上站着一个身形由流动的暗物质与闪烁的量子泡沫组成的身影——自称“溯源之主”的存在。
“秦溯，你们所谓的文明不过是宇宙的赘生物。”溯源之主的声音如同远古星辰的坍缩，“唯有让溯源暗流将一切带回奇点，才能洗净宇宙的‘原罪’，实现真正的纯净。”他挥动由时空弦线编织的权杖，幽蓝色暗流如银河倒卷般扩散，所到之处，繁华的星际都市分解成宇宙尘埃，传承千年的文明典籍化为甲骨残片，自由残缺派与火种重启派的终极传承在溯源之力下消散于无形。
秦溯发现，任何阻止溯源的力量都会加速暗流侵蚀，唯有唤起生命对“存在本源”的深刻认知。他紧急发起“寻根共鸣计划”，号召全宇宙生命体回溯种族起源的记忆：地球生命对原始海洋的本能眷恋、机械文明对第一行代码的初始悸动、灵能种族对混沌中第一缕能量的感知。这些跨越时空的本源印记，通过量子网络汇聚成“破晓之辉”，注入秦溯以永恒新生圣殿为核心重塑的“溯源熔炉”。
秦曦带领团队，融合永恒本源圣殿的创生之力与永恒法则圣殿的秩序智慧，制造出“时空溯源矩阵”。他们深入各个受侵蚀区域，用声波震动唤醒物质的原始记忆，以光影艺术重现宇宙诞生的壮丽场景，将那些濒临消散的文明火种与原始能量进行调和。在一颗被暗流笼罩的科技星球上，团队成员将现代科技结晶与远古图腾结合，构建出抵抗溯源的能量结界。
最终决战在虚无祭坛展开。秦溯高举燃烧着破晓之辉的溯源熔炉，与溯源之主展开一场超越时空维度的较量。在光芒的照耀下，溯源之主流动的身影开始凝固，暗物质与量子泡沫逐渐融合，露出其下由无数被压抑的宇宙真相组成的核心。当他看到宇宙中无数生命在溯源暗流中，依然坚持追寻本源的画面——考古学家在尘埃中寻找文明火种、哲学家在混沌中思索存在意义、普通人用信念守护心中的生命之光——眼中的冷漠逐渐被触动：“原来...存在的价值，在于追寻本源的过程...”
随着溯源之主的消散，溯源暗流转化为重塑宇宙的“新生原力”，原初裂隙化作一片“万象溯源星海”，每一颗星辰都代表着一个重新理解本源的文明。危机过后，秦溯在青山村建立“永恒溯源圣殿”，圣殿中央的巨型装置不断吞吐、融合着原始与新生的能量，象征着宇宙的轮回与进化。新石碑上刻着：“虚空低语，文明溯源。医道的终极守护，是让每个生命在追寻本源的道路上，永远保持探索的勇气，书写属于自己的存在诗篇。”
星河之中，秦逸与林婉的星光融入万象溯源星海与永恒溯源圣殿的光芒，照亮宇宙前所未有的纪元。医道的传承者们深知，只要生命对真相的渴望不灭，无论面对怎样的时空危机，都能在混沌的深渊中，开辟出属于文明的璀璨未来。