意识圣坛的光辉照亮宇宙纪元后，一场超越所有认知的终极危机悄然降临。无界医盟的多维监测系统同时崩溃，整个宇宙的物质、能量、法则乃至意识，都开始向一个神秘的“归元点”坍缩。恒星、行星、星系，甚至时空本身，都在以违背常理的速度压缩，仿佛整个宇宙正在被吸入一个吞噬一切的“归元漩涡”。更诡异的是，归元漩涡中传出一种超越语言的嗡鸣，像是无数文明的叹息与新生的胎动交织。
秦溯在医道传承院感知到异动时，老槐树的树干轰然炸裂，从中飞出初代神农最后的意识碎片。碎片在空中凝聚成一道光门，光门中浮现出宇宙从诞生到此刻的所有画面，最终定格在一片混沌与新生交织的景象：“万物归元非终局，而是新生的序曲。当一切回归本源，唯有以万生的意志为引，方能在虚无中重塑永恒。”与此同时，秦曦的实验室被归元能量侵袭，所有设备在瞬间分解又重组，最终形成一个不断收缩的能量球，球内闪烁着宇宙大爆炸前的原始代码。
循着归元漩涡的引力，探索小队踏入宇宙核心的“虚无之境”。这里不再是任何已知的存在形态，而是一片混沌的能量海洋，所有的概念、规则与实体都在此刻失去意义。漩涡中央，一座由破碎的宇宙模型与未成形的法则碎片堆砌而成的“归元圣殿”缓缓升起，殿中走出一个由光、暗、物质、能量、意识交织而成的身影——自称为“归元之主”的存在。他的声音裹挟着创世与毁灭的双重韵律：“秦溯，你们徒劳地守护着破碎的宇宙，却不知唯有让万物归元，才能彻底摆脱所有的苦难与纷争。”
归元之主挥动权杖，归元漩涡开始加速，宇宙坍缩的速度达到恐怖的程度。被波及的星球，山川大地瞬间压缩成微小的质点，生命体在归元能量的撕扯下濒临崩溃。自由残缺派与火种重启派的联合舰队在漩涡中被撕成基本粒子，他们的科技与魔法在归元之力面前如同儿戏。秦溯发现，常规手段不仅无法阻止坍缩，反而会加速归元进程，唯有找到超越归元与存在的“永恒本质”。
生死存亡之际，秦溯发起“永恒新生计划”。他向全宇宙发出最后的号召，征集每个文明最坚韧的生命力、最炽热的希望与最纯粹的信念。从原始生命在极端环境下的顽强生存，到高等文明对宇宙真理的不懈追求，这些跨越时空的意志之力，通过量子网络汇聚成“永恒火种”，注入秦溯的青铜罗盘。秦曦带领团队，利用意识圣坛的能量，制造出“归元调和核心”，试图在坍缩中寻找新生的可能。
最终决战在归元圣殿展开。秦溯高举燃烧着永恒火种的罗盘，与归元之主展开一场关乎宇宙命运的终极较量。在火种的光芒中，归元之主的矛盾身躯开始融合，所有对立的概念不再冲突，露出其下由无数可能性组成的核心。当他看到宇宙中无数生命在归元的威胁下依然相互扶持，用信念在虚无中开辟希望之路的画面——科学家用最后的智慧计算新生公式，艺术家以灵感绘制未来蓝图——眼中的偏执逐渐被理解取代：“原来...真正的永恒，不是万物归元，而是在不断的毁灭与新生中，生命永不熄灭的意志...”
随着归元之主的消散，归元漩涡转化为重塑宇宙的“创生熔炉”，坍缩的能量逆变成孕育万物的“新生之力”。虚无之境化作一片“万象星河”，每一颗星辰都代表着一个全新的宇宙法则与文明形态。危机过后，秦溯在青山村建立“永恒归元碑”，碑身由全宇宙文明的记忆、意志与希望熔铸而成，顶端的永恒火种永不熄灭。新石碑上刻着：“万物归元，新生永恒。医道的终极传承，是让每个生命都能在毁灭与重生的循环中，永远追寻光明的未来。”
星河之中，秦逸与林婉的星光融入万象星河与永恒归元碑的光芒，与全宇宙的生命之光交相辉映。从此以后，医道的传承者们带着这份信念继续前行，他们深知，只要生命的意志尚存，无论面对怎样的危机，宇宙都将在永恒的归元与新生中，绽放出更加绚烂的光彩，续写永无止境的传奇。