宇宙的短暂平静如薄冰覆盖暗流。当各方势力还在消化“女娲密钥”的真相时，秦逸与林婉在观星阁遗址的地底发现了异常——数以万计的银色丝线正从岩层深处蔓延而出，每根丝线都缠绕着晶莹的茧状物，内部隐约可见蜷缩的人形轮廓。林婉石化的指尖突然发烫，那些丝线竟自动避开她的触碰，在地面勾勒出初代神农的符文：“茧生万相，非生非死”。
消息不胫而走，火种重启派与自由残缺派再次剑拔弩张。新上任的火种重启派领袖凯恩在全息会议中厉声质问：“林婉，这些茧是不是织夜者的阴谋？你们早该清除这些隐患！” 林婉正要反驳，其中一个茧突然发出清脆的碎裂声，爬出一个皮肤泛着金属光泽的孩童。孩子空洞的眼神扫过众人，张开嘴吐出一串令所有翻译系统崩溃的量子代码。
秦逸立即展开医道探测，却发现这些茧内的生命体既没有传统意义上的基因链，也不存在能量波动，更像是“概念的具象化”。“他们像是...某种文明的备份。” 他皱紧眉头，神农信物在怀中发烫，“但这种技术超越了我们已知的所有医疗体系。” 话音未落，茧群突然集体震颤，地底传来齿轮转动的轰鸣，整片遗址开始下沉，将众人拖入一座由液态星光浇筑的地下宫殿。
宫殿穹顶悬浮着巨大的星图，每颗星辰都对应着一个茧。林婉的石化能力与星图产生共鸣，无数记忆碎片如流星雨般坠落——她看到初代神农与神秘种族“织梦者”签订契约的场景。原来在宇宙诞生初期，织梦者预见了文明必将陷入“完美与残缺”的永恒争斗，于是创造了“茧中纪元”计划：将每个时代最具潜力的生命意识封存，待文明濒临崩溃时重启。
“这些茧是文明的种子，也是...诅咒。” 林婉颤抖着解读记忆，“每颗茧都需要对应时代的医者献祭生命才能激活。” 她的目光落在秦逸身上，后者已悄悄运转神农传承，准备随时应对危机。而此时，茧群中突然传来熟悉的声音——自由残缺派已故领袖的意识竟附着在某个茧上：“秦逸，林婉，只有你们能打破这个轮回...”
与此同时，地表的局势急转直下。熵蚀会残余势力混入各方阵营，散布“茧中藏着毁灭武器”的谣言。凯恩被煽动的情绪冲昏头脑，下令向遗址发射湮灭导弹。千钧一发之际，白焰驾驶改装后的飞船冲入导弹轨道，用医道星核的力量将其牵引至虚空中爆炸。但这一举动暴露了星核的位置，暗处的神秘组织“墨渊”悄然锁定了他的坐标。
在地下宫殿，秦逸与林婉面临更严峻的抉择。茧群开始自主吸收周边能量，宫殿的液态星光逐渐凝固成尖锐的晶体。若不激活茧中意识，整个地下空间将坍缩成黑洞；若强行激活，献祭者将化作维持茧中世界的“活体能源”。“让我来。” 林婉走向最近的茧，石化的皮肤泛起温暖的光泽，“我的身体本就是半石化状态，或许能撑得更久。”
“胡闹！” 秦逸一把拉住她，神农传承的力量在周身沸腾，“初代神农留下的不仅是医道，还有破局的智慧。” 他将双手按在星图上，引导医道之力逆向运转——既然茧是文明的备份，那能否用“治愈”的概念重新编写其底层逻辑？随着光芒暴涨，茧内的生命体开始浮现清晰的面容，许多竟与在场众人长得一模一样。
地表上，白焰被墨渊组织围困在小行星带。对方的飞船装备着能分解星核能量的“熵蚀切割器”，每道光束划过，医道星核的光芒就黯淡一分。千钧一发之际，茧中纪元的能量波动意外干扰了墨渊的武器系统。白焰趁机启动飞船的自毁程序，在爆炸前将星核抛向地球方向——那里，秦天明与苏瑶的虚影正在云层中若隐若现，似乎在等待着什么。
地下宫殿内，秦逸与林婉的尝试终于成功。茧中的生命体不再需要献祭激活，而是化作流光融入他们体内。当最后一个茧消散时，初代神农的虚影与织梦者一同浮现：“你们用自由意志改写了既定命运。” 话音未落，整个宇宙的星空中同时亮起茧状星云，无数沉睡的文明种子开始苏醒，而秦逸与林婉的身影，也化作守护这些种子的永恒星光。