熵寂源核的崩解并未带来真正的安宁，散布宇宙的“熵寂火种”如同蛰伏的毒瘤，在暗物质与暗能量的缝隙中悄然生长。裂缝文明的监测系统捕捉到异常波动——这些火种正以量子纠缠的方式构建新的网络，暗紫色的能量脉络在星系间蔓延，所过之处，恒星提前步入衰亡，行星磁场紊乱扭曲。不完美之种仅存的灰烬突然迸发微光，传递出最后的预警：“火种...在孕育新的熵寂意识！”
秦逸的平衡印记泛起暗红色的脉络，他的意识被拽入一片由破碎火种组成的虚域。这里悬浮着无数暗紫色的能量团，每个能量团中都隐约浮现出熵寂意识的残影。残存的熵寂意识化作火种间的低语，声音带着卷土重来的阴鸷：“秦逸，只要火种不灭，熵寂便永恒。这次...你们将见证更完美的毁灭。”虚域中投影出恐怖景象：机械文明的量子计算机被火种入侵，沦为散播熵寂的工具；修真文明的灵气网络遭到腐蚀，修士们在癫狂中自相残杀。
觉醒者们意识到，常规手段无法彻底根除火种。他们决定启用初代神农遗留的“净化回廊”，这是一套能将物质与能量分解重组的装置，但需要全宇宙文明共同提供“净化因子”——那是文明在抗争中淬炼出的纯粹生命力与希望意志。众人驾驶“清墟号”战舰，穿梭于各个星系，收集文明火种的同时，还要抵御“熵寂余孽”的攻击。这些余孽由火种衍生而成，形态千奇百怪：有的是能寄生在生命体意识中的“噬念虫群”，有的是操控暗物质的“虚空织影者”，所到之处，空间被撕扯成碎片，时间线出现致命扭曲。
“它们的弱点在于火种能量的排异反应！”小女孩将机械心脏与全宇宙文明的生命共鸣系统相连，启动“净化共鸣阵列”。金色的净化能量与暗紫色的火种能量激烈碰撞，产生的震荡波迫使部分余孽显露出核心火种。秦逸抓住机会，挥动融合武器，斩出“逆命清墟斩”，剑刃上的平衡印记迸发净化之力，暂时压制了敌人。
清墟号抵达净化回廊启动点，却发现熵寂火种已抢先一步形成“暗火矩阵”，阻止回廊运转。矩阵中央，新生的熵寂意识凝聚成半透明的暗紫色巨茧，声音充满压迫感：“当矩阵吸收足够的熵寂能量，所有文明都将被炼化为新的火种！”巨茧突然释放“暗火焚世波”，暗紫色的能量浪潮所到之处，物质被点燃成虚无，能量被扭曲成混乱的暗火。清墟号的船员们的身体开始出现碳化症状，意识在暗火侵蚀下濒临崩溃。
千钧一发之际，秦逸引导全宇宙文明对彻底胜利的渴望、对和平未来的向往，将共生之力注入净化回廊。回廊启动的瞬间，金色的净化之光与暗火焚世波激烈对抗，在虚空中凝聚出“永恒净域”。“文明的意志，终将焚尽黑暗！”秦逸将全宇宙文明的净化因子、初代神农的净化传承，以及不完美之种灰烬中残留的生机融合，发动“逆命火种尽灭”。
璀璨的净化能量洪流轰击暗火矩阵，整个宇宙剧烈震颤。新生的熵寂意识发出尖锐的惨叫，巨茧开始崩解，但在毁灭前，无数暗紫色的“火种孢子”通过量子通道扩散至更遥远的宇宙角落。秦逸望着逐渐恢复平静却仍暗藏危机的星空，深知这场清扫熵寂余烬的战争，需要文明永远保持警惕——只要还有一丝熵寂的痕迹，宇宙的和平就如风中残烛，随时可能熄灭。