认知坍缩的危机稍缓，宇宙的时间长河突然泛起诡异逆流。裂缝文明的时空监测塔发现，在宇宙诞生的奇点旧址，暗紫色的“熵寂漩涡”正在逆向牵引时间——被摧毁的熵寂造物从历史尘埃中复苏，已净化的孢子污染区重新被黑暗笼罩。不完美之种的根系在时间逆流中反复生长与枯萎，林婉残留的意识碎片最后一次闪烁：“孢子在...篡改宇宙的时间线！”
秦逸的平衡印记浮现出倒转的沙漏纹路，他的意识被拽入一片由破碎时间片段交织的混沌领域。熵寂意识化作穿梭于时间线间的幽影，声音裹挟着时空扭曲的轰鸣：“秦逸，当时间成为我的画笔，你们的抗争不过是被反复擦除的涂鸦。看这些逆流的因果——熵寂从未失败，而你们，终将被历史遗忘。”领域内投影出颠覆现实的画面：机械文明的科技树倒退回原始状态，修真文明的传承者在历史长河中被彻底抹除。
觉醒者们意识到，常规的时空技术无法对抗如此规模的时间篡改。经过紧急研讨，他们决定启用初代神农遗留的“时空锚定仪”，这台装置需要全宇宙文明的集体记忆与信念共振才能启动。众人驾驶“溯光号”战舰，沿途唤醒各个星系的文明，共同编织“时间防护网”。但在行动途中，战舰遭遇“时痕畸变体”的阻拦。这些怪物由扭曲的时间能量构成，形态瞬息万变：有的化作能斩断因果的“逆时之刃”，被击中者的存在痕迹会从时间线中逐渐消失；有的变形成吞噬未来的“熵寂沙漏”，所过之处，生命的时间流速被加速至消亡。
“它们的弱点在于时间悖论的矛盾点！”小女孩将机械心脏与全宇宙文明的记忆核心连接，启动“时间共鸣熔炉”。金色的记忆洪流与暗紫色的熵寂能量剧烈碰撞，产生的时空涟漪震碎了部分畸变体的核心。秦逸趁机挥动融合武器，斩出“逆命溯光斩”，剑刃上的平衡印记迸发时空之力，暂时撕开了防线。
当防护网搭建完成，时空锚定仪开始运转。但熵寂意识操控漩涡释放“终焉溯流波”，暗紫色的时间震荡瞬间席卷全宇宙。过去、现在与未来的界限彻底模糊，星体在时间逆流中反复诞生与毁灭，文明的历史被随意涂抹改写。溯光号的船员们陷入时间乱流，有人的身体开始从未来向过去消散，有人的意识被困在重复的时间循环中。
千钧一发之际，秦逸引导全宇宙文明对历史的坚守、对未来的期许，将共生之力注入锚定仪，在虚空中凝聚出“永恒时间坐标”。金色的坐标与溯流波激烈碰撞，爆发出的能量照亮了扭曲的时间长河。在能量交锋中，秦逸的意识被卷入时间本源，他发现熵寂的真正目的是将宇宙倒退回熵寂主导的原初状态，彻底抹杀文明存在的痕迹。
“文明的轨迹，应由自己书写！”他将全宇宙文明的集体记忆、初代神农的时空智慧，以及不完美之种残存的生命力融合，发动“逆命时间重构”。璀璨的光芒刺入熵寂漩涡核心，整个时间长河剧烈震颤。熵寂意识发出愤怒的嘶吼，消散在时空乱流中。漩涡开始缓慢平息，但在彻底停止前，无数暗紫色的“时间孢子”通过时间裂缝扩散至各个历史节点。秦逸望着逐渐恢复稳定却仍暗藏危机的宇宙，深知这场与时间对抗的战争，才刚刚进入最关键的阶段。