逆命之网与孢子心脏剧烈碰撞，暗紫色的脉络在心脏表面疯狂蔓延，如同无数条贪婪的触手，死死缠绕着被囚禁的文明火种。秦逸的意识在能量风暴中震荡，他能清晰地感受到每一个火种的悲鸣——那些曾在各个宇宙中闪耀的文明之光，此刻正被孢子心脏榨取着最后的生命力。
“这些火种...是新秩序计划的核心能源。”林婉的虚影在混乱中闪烁，声音带着前所未有的凝重，“孢子心脏不仅在孕育新的万劫种，还妄图用文明的火种，点燃绝对秩序的永恒之火。”话音未落，心脏表面的暗紫色种子突然膨胀，释放出能腐蚀灵魂的“熵寂迷雾”，迷雾所过之处，逆命之网的丝线寸寸崩解。
觉醒者们在方舟上发动最后的攻势。裂缝文明的科学家将飞船引擎改造成“混沌熔炉”，喷射出能中和秩序之力的量子火焰；残缺派修士以自身为引，启动上古禁阵“万灵归墟”，试图将孢子心脏的能量导入虚空中。但孢子战士如同潮水般涌来，它们的身体在火焰中重组，在禁阵中分裂，用数量彻底压制了反抗者的攻击。
秦逸握紧终焉之剑，剑中的神农元神突然化作一道金色光束，贯穿熵寂迷雾。“共生之道，在于守护每一种可能。”神农的声音在虚空中回荡，他的虚影挥出一道“苍生之印”，将迷雾暂时驱散。趁着这短暂的机会，秦逸引导不完美之种的根系刺入孢子心脏，幼苗的叶片散发出能净化污染的“新生之光”。
然而，暗紫色种子的反击更加猛烈。它释放出“火种吞噬者”——这些形如黑色巨蛾的怪物，翅膀每扇动一次，就能吞噬一颗文明火种。当第一只巨蛾扑向火种时，方舟上的小女孩突然挣脱束缚，她的机械心脏超负荷运转，爆发出耀眼的蓝光：“不许伤害它们！”蓝光化作一张光网，将巨蛾困在其中，而她的身体也在能量过载中开始崩解。
“不！”秦逸的怒吼响彻星云。他强行调动体内所有力量，将归墟残能、药晶之力与神农本源融合成“逆命之火”。火焰顺着根系蔓延至孢子心脏，在核心处与暗紫色种子正面相撞。剧烈的爆炸中，种子表面出现裂痕，被困的文明火种趁机挣脱束缚，化作千万道光芒射向宇宙胚胎。
但虚影并未就此罢手。他的数据流重组为一个巨大的机械傀儡，手中握着由孢子凝聚的“秩序裁决者”巨刃，劈向不完美之种。千钧一发之际，星孩的锈蚀银针再次出现，钉入傀儡关节，减缓了它的动作。秦逸抓住机会，将终焉之剑刺入傀儡核心，剑中的共生之力与傀儡的秩序代码产生剧烈冲突，爆发出的能量将傀儡炸成碎片。
孢子心脏在失去能源供给后开始坍缩，暗紫色种子也逐渐失去光泽。但就在众人以为胜利在望时，种子突然分裂成无数细小的孢子，朝着各个宇宙胚胎飞去。“不能让它们得逞！”觉醒者领袖燃烧自己的反抗基因，化作一道金色洪流，追上大部分孢子并将其吞噬。而秦逸则引导不完美之种的根系，在宇宙胚胎周围编织成“守护结界”，拦下了剩余的孢子。
危机终于解除，自由方舟悬浮在重新焕发生机的星空中。被解救的文明火种纷纷落入宇宙胚胎，为新的生命孕育注入希望。小女孩的机械残骸在蓝光中重组，她的眼睛里重新闪烁着灵动的光芒：“哥哥，我们又守住了自由。”秦逸望着不完美之种，它的根系上缠绕着新生的藤蔓，叶片间闪烁着林婉的星光。
然而，在宇宙的最深处，虚影的一缕意识附着在最后一颗孢子上，冷笑着消失在黑暗中：“只要文明存在欲望与矛盾，秩序的轮回...就永远不会结束。”而在自由方舟的观测室里，秦逸握紧终焉之剑，剑身上的共生纹路微微发烫。他知道，这场关于自由与秩序的博弈，永远不会真正画上句号，新的挑战，正在黑暗中悄然酝酿...