翡翠星的熵钟圣殿在暗物质云的侵蚀下，金色光芒变得忽明忽暗。秦逸与林婉带着三块医道残章返回时，发现圣殿的地面正以诡异的规律震颤，每一次震动都伴随着古老的符文亮起又熄灭。“这些符文的排列顺序，和《黄帝内经》记载的‘子午流注’如出一辙。”林婉轻抚地面，治愈能量顺着纹路游走，却在触及某处时被一股无形力量弹开。
秦逸将银针插入符文节点，金芒顺着纹路蔓延，突然在圣殿中央汇聚成一道旋转的时空漩涡。“这漩涡的能量波动...和我们在意识之海见过的记忆通道很相似。”他握紧残章，“或许时间尽头的线索，就在钟底。”两人对视一眼，毅然踏入漩涡。时空扭曲的剧痛中，他们的意识体仿佛经历了无数个文明的兴衰，最终坠落在一片由齿轮与星轨交织的奇异空间。
这里是熵钟的核心舱室，巨大的钟摆每一次摆动都带动时空涟漪，墙壁上刻满了从宇宙诞生到如今的所有熵律变迁。三块医道残章突然发出共鸣，悬浮在空中拼凑出半幅星图，图中闪烁的光点指向舱室深处的一扇青铜门。门上镌刻着初代道侣的留言：“欲见终章，先解生死之惑。”
当秦逸伸手触碰青铜门，门内立刻涌出无数透明人影。这些人影皆是在熵影危机中逝去的医者，他们的身体布满暗紫色伤痕，眼中却闪烁着坚定的光芒。“我们是被困在熵钟里的执念。”为首的老者开口，声音如洪钟般响彻舱室，“若想通过，需证明你们配得上混元医典。”
话音未落，舱室内的时空突然扭曲，秦逸与林婉被传送到不同的战场幻象中。秦逸置身于机械文明的末日废墟，无数失控的战争机器人正在互相残杀，空气中弥漫着刺鼻的硝烟。他挥动银针，试图修复机器人受损的核心程序，却发现它们的芯片被植入了“毁灭即救赎”的扭曲指令。“这些机器人的逻辑回路就像被堵塞的经络。”他将银针化作数据流注入芯片，“以《黄帝内经》的调和之道...或许能重启它们的意识！”
与此同时，林婉身处魔法文明的腐化森林。曾经生机勃勃的树木化作缠绕着荆棘的怪物，释放出的毒气正在腐蚀周围的一切。她释放治愈能量，却发现怪物的核心处跳动着一颗被金色暗纹污染的“生命水晶”。“原来如此，这些怪物不是邪恶，而是病入膏肓的生命。”林婉双手结印，将治愈能量转化为净化光束，“让我为你们祛除病根！”
当两人分别净化了幻象中的危机，青铜门缓缓开启。门后是一座悬浮在虚空中的祭坛，祭坛中央漂浮着最后一块医道残章，残章表面流转的光芒竟与熵钟的能量波动完全同步。但祭坛四周，环绕着十二尊手持武器的雕像——这些雕像的面容，竟是秦逸与林婉未来可能堕落的模样。
“这是熵影之主留下的最后考验。”初代道侣的意识突然浮现，她的虚影在残章旁闪烁，“当希望太过沉重，人便会走向极端。若你们无法战胜内心的黑暗，混元医典反而会成为毁灭的凶器。”话音刚落，十二尊雕像同时苏醒，他们的武器上缠绕着暗紫色能量，每一次攻击都带着令人绝望的威压。
秦逸与林婉再度融合，银针与治愈能量交织成光盾。面对“堕落的自己”，他们没有选择一味防御，而是将光芒注入雕像的武器：“黑暗也是我们的一部分，但我们不会被它吞噬！”当光盾触及雕像的瞬间，暗紫色能量开始消退，雕像的面容逐渐恢复清明，最终化作十二道金色光束，汇入最后一块残章。
残章与前三块完美契合，在空中旋转着组成完整的混元医典。医典表面浮现出宇宙万物的生灭图景，每一幅画面都蕴含着平衡光明与黑暗的医道真谛。然而，就在秦逸与林婉准备触碰医典时，熵影之主的狂笑突然响彻整个空间：“等的就是这一刻！”一道暗紫色的漩涡在医典上方成型，瞬间将其吞噬。
“不！”两人冲向漩涡，却被一股强大的力量弹开。熵影之主的身影从漩涡中缓缓走出，他的手中握着散发着邪恶光芒的混元医典：“当你们集齐残章的那一刻，就已经输了。现在，我将用这本医典...让整个宇宙陷入永恒的熵影！”而在他身后，被污染的混元医典正在释放出足以扭曲时空的恐怖能量，一场关乎宇宙存亡的最终决战，已然迫在眉睫。