星云爆炸的余波尚未平息，林婉与秦逸便在星孩善体的指引下，借助虹桥医链的残余功能，找到了初代道侣遗留的“因果回廊”。这座隐藏在时空夹缝中的神秘空间，由无数悬浮的水晶回廊构成，每条回廊都连接着不同时间线的重大抉择。当穿梭舰穿过扭曲的时空入口时，望舒的基因烙印突然剧烈震颤，少年的盲眼泛起幽蓝光芒：“这里...有好多声音在争吵，是不同的‘我们’在做选择...”
踏入回廊的瞬间，林婉的晶化右手传来灼烧般的剧痛，《混沌医典》自动翻开，空白页渗出暗红文字：踏入因果，直面心魔，当过去与未来的刀刃相向，观测者将在抉择中破碎重生。秦逸的银针碎片不受控制地悬浮空中，银芒在回廊中折射出无数倒影，每个倒影都对应着一个平行世界的他们——有的身着齿轮组织的黑袍，有的化为熵化主宰，还有的倒在血泊中，手中紧握着破碎的因果锚。
“小心！这些倒影是实体！”秦逸话音未落，一名黑袍“秦逸”已挥剑袭来，剑刃上缠绕着观测者之力与熵化能量的混合体。林婉迅速挥动因果锚抵挡，金色光芒与黑色剑气相撞，爆发出震耳欲聋的轰鸣。战斗中，她发现黑袍“秦逸”的攻击招式中，竟夹杂着她最熟悉的救援手法——这分明是被黑暗吞噬后的他们。
回廊深处，传来齿轮组织首领的狂笑：“欢迎来到命运的迷宫，林婉，秦逸！在这里，你们将亲眼见证所有失败的可能！”随着笑声，无数由悔恨与恐惧凝聚的怪物从水晶墙壁中爬出，它们的形态正是林婉未能拯救的患者、秦逸误伤的挚友。望舒的笛声在颤抖中响起，基因烙印的音波却被怪物们吸收，转化为更强大的攻击。
秦逸在怪物的围攻下逐渐陷入困境，观测者之力的封印处传来撕裂般的疼痛。当一只形似星孩恶体的怪物刺穿他的肩膀时，他的意识突然被拽入一段从未见过的记忆：未来的林婉手持“罪孽针”，含泪将其刺入他的心脏，而宇宙在他们身后分崩离析。“这不可能...”秦逸的声音带着颤抖，但怪物趁机发动致命一击。
千钧一发之际，林婉的因果锚挡下攻击。她的眼中燃烧着坚定的光芒：“秦逸，还记得我们在医罪审判时说过的话吗？无论面对怎样的未来，我们都要守护此刻的选择！”她将信任之力注入秦逸体内，两人的力量交融的瞬间，回廊产生剧烈震动。那些倒影与怪物开始出现裂痕，显露出其虚幻本质。
在混乱中，秦青鸾残识的善意意识再次现身。他的虚影引导两人进入回廊核心，那里矗立着七面巨大的镜子，每面镜子都映照出一个与熵种危机相关的关键抉择。当林婉触碰其中一面镜子时，镜中浮现出初代道侣将星孩双体分离的场景，而在画面角落，一个模糊的身影正在暗中操控一切——那身影的轮廓，竟与望舒有几分相似。
“第三股力量...难道是望舒？”秦逸的推测让空气瞬间凝固。但未等他们深入探究，齿轮组织首领突然发动攻击，整个因果回廊开始崩塌。首领的身体由观测者之眼碎片重组而成，手中握着的权杖顶端，镶嵌着第三根生命琴弦：“你们太晚了！当七弦共鸣，因果回廊将成为埋葬宇宙的棺材！”
林婉与秦逸拼尽全力抵抗，银针的银芒与因果锚的金光交织成网，试图阻拦首领。关键时刻，望舒将短笛刺入自己的基因烙印，爆发出耀眼的蓝光。音波化作苏瑶根系的形态，缠住首领的脚踝，为两人争取到宝贵的时间。秦逸趁机将银针碎片组成初代道侣观测者之眼的形态，与林婉的因果锚同时发动最强一击。
光芒与黑暗的碰撞中，因果回廊彻底崩解。首领在消散前将生命琴弦抛入时空裂缝，狞笑道：“去银河中心找吧！在那里，你们将见证真正的终局！”林婉握紧手中破损的因果锚，望着裂缝深处闪烁的光芒：“无论前方是什么，我们都要走下去。因为我们是医者，更是观测者。”而望舒在战斗后陷入昏迷，他的基因烙印中，一段被封印的记忆正在悄然苏醒。