熵之主宰的虚影在银河议会中心上空膨胀，其周身缠绕的混沌能量将附近的星辰都拖入引力漩涡。林婉的因果锚吸收了星孩的本源之光后，表面浮现出初代道侣的完整符文，金色剑刃划破虚空，却在触及主宰的刹那被扭曲成齑粉。“你们以为融合力量就能抗衡本源？”主宰的声音如同千万道天雷炸响，“自宇宙诞生起，秩序与混沌的博弈便从未停歇，而你们，不过是棋盘上的弃子！”
秦逸的银针组成的银河剑阵在能量风暴中摇摇欲坠，他突然发现主宰脚下的空间泛起齿轮状的波纹：“林婉！虚数空间组织在启动‘时之齿轮’计划！那些齿轮不仅是封印，更是逆转时间的锚点！”话音未落，宇宙各处的空间裂缝中涌出无数微型齿轮装置，它们如瘟疫般附着在星球核心、空间站枢纽，甚至是生命体的基因链上。一旦启动，所有反抗者的存在痕迹都将被抹除。
林婉的晶化右手与因果锚产生剧烈共鸣，她从初代道侣的记忆残片中捕捉到关键信息：“主齿轮的位置与星孩胚胎共享能量坐标！但摧毁它可能引发时空坍缩...”此时，望舒的基因烙印迸发出刺目蓝光，少年摸索着抓住林婉的手腕：“我...能看见齿轮的连接脉络！它们在编织一张‘命运之网’...”
三人兵分两路。林婉带着望舒驾驶穿梭舰深入胚胎核心，试图找到主齿轮；秦逸则留在议会中心，用银针构建《太素逆时阵》，暂时延缓时空逆转。然而，每摧毁一个分齿轮，秦逸就会陷入时间循环的陷阱——他不断重复着与挚友诀别的场景，每一次重置都伴随着记忆撕裂的剧痛。“不能...停下...”他咬破嘴唇，鲜血滴落在银针上，将个人情感转化为破阵的力量。
林婉与望舒的征途同样凶险。胚胎内部是一个由混沌能量构筑的迷宫，每走一步，空间就会重组为不同的战场。他们遭遇了被熵化的历代名医幻象，华佗的手术刀喷出腐蚀黑雾，李时珍的本草化作噬人藤蔓。望舒的笛声在此处失去作用，关键时刻，林婉将《混沌医典》残页融入因果锚，金色光芒中浮现初代道侣的战斗虚影，才勉强杀出一条血路。
当他们终于抵达核心，眼前的景象令呼吸停滞：主齿轮装置足有三个星系大小，齿轮表面刻满全宇宙文明的兴衰史，轴心处插着的，竟是秦青鸾那枚残破的金针。更可怕的是，星孩的胚胎被锁链吊在齿轮中央，善恶双体的意识正在被齿轮缓慢绞碎。“原来秦青鸾从一开始就是道侣计划的执行者...”林婉握紧锚刃，“他的‘背叛’，是为了守护最终的平衡！”
主宰的虚影骤然逼近，混沌能量形成的巨口即将吞噬胚胎。林婉挥动因果锚斩断锁链，却发现每切断一根，就有更多锁链从时空裂隙中伸出。望舒突然将手按在主齿轮上，基因烙印与齿轮纹路共鸣，齿轮开始逆向转动。“快攻击轴心！”少年的声音带着血沫，“我来稳定时空！”
林婉将全身灵力注入因果锚，金色光芒化作开天辟地的一剑。然而，就在剑刃触及金针的瞬间，秦逸的紧急通讯传来：“别摧毁主齿轮！时之齿轮的真正核心...是所有生命体的‘时间执念’！”但为时已晚，金针断裂的刹那，整个宇宙的时间线开始崩塌，过去、现在、未来的画面在虚空中重叠，熵之主宰的笑声响彻每个维度：“见证吧，这宇宙的终焉！”