克莱因星域的危机暂告一段落后，星穹联盟将维度法则碎片的研究转入地下，却未料到沾染暗物质的碎片残片已随着科研废料流入宇宙。三个月后，边缘星球“锈河城”爆发诡异疫情：居民皮肤逐渐结晶化，眼中浮现暗物质特有的紫色星芒，他们开始无意识地聚集向星球核心，仿佛被某种神秘力量召唤。
艾克斯带领医疗小组抵达时，整座城市已沦为“晶体坟场”。建筑物表面覆盖着蛛网状的紫色结晶，街道上凝固着市民奔跑求救的晶体残骸。诺拉的星轨推演仪检测到，这些结晶的分子结构与暗物质、维度法则碎片产生三重共鸣。“这是维度污染引发的变异，”她的声音发颤，“暗物质正在将生物转化为‘维度锚点’。”
更致命的是，疫情通过空间跃迁贸易链迅速扩散。当联盟启动隔离措施时，已有十七个星系出现感染病例。被感染的生物在临终前会集体望向星空某处，那里正是暗物质碎片坠落的方向——一片被称为“虚无之喉”的黑洞群区域。伊芙琳的意识体在分析海量数据后，惊觉疫情的传播路径竟与鸿蒙时代记载的“熵灾”轨迹完全吻合。
“虚无之喉的黑洞群在吞噬维度裂缝的同时，正在孵化暗物质的‘病原体母体’。”莱昂的意识凝聚成黯淡的光点，“必须在母体成熟前摧毁它，否则整个宇宙将沦为暗物质的殖民地。”艾克斯组建敢死队，携带由生命古树精华与秩序之力融合的“净化弹头”，航向虚无之喉。
舰队进入黑洞群时，所有常规武器失灵，导航系统显示他们正在同时飞向多个不同坐标。诺拉突然指着星图惊呼：“这些黑洞根本不是天体，而是被暗物质伪装的维度虫卵！”话音未落，周围的黑洞突然睁开紫色巨眼，喷出的暗物质流将多艘战舰瞬间转化为晶体残骸。
艾克斯临危不乱，指挥舰队启动“概率规避”技术，在无数可能的航线中寻找生路。当舰队终于抵达病原体母体所在的巨型黑洞时，眼前的景象令人窒息：黑洞内部悬浮着一颗由亿万晶体组成的心脏，每一次跳动都向外喷射出暗物质瘟疫的孢子。
“净化弹头需要三分钟充能，我们必须拖住母体！”艾克斯挥舞秩序权杖，释放出历代守护者的虚影，与暗物质触手展开缠斗。诺拉则操纵星轨推演仪，利用黑洞的引力波动制造时间扭曲，为充能争取宝贵时间。就在弹头即将完成充能时，母体突然分裂出无数晶化分身，其中一个穿透防护网，将艾克斯的手臂瞬间结晶化。
“守护者的信念，永不结晶！”艾克斯怒吼着扯断结晶手臂，用秩序之力重塑肢体。他强撑着将净化弹头推入母体核心，耀眼的光芒中，暗物质晶体开始成片剥落，显露出母体的真实形态——那是被暗物质侵蚀的苏尘与洛瑶融合体，他们的面容在痛苦中扭曲。
“原来……母体是他们的残影……”诺拉泪目。莱昂的意识在此刻化作光柱，包裹住逐渐消散的母体：“鸿蒙时代的牺牲者，就让我们来超度。”随着净化光芒扩散，暗物质瘟疫终于得到控制。但在虚无之喉的最深处，一枚沾染着莱昂意识碎片的暗物质晶体悄然沉入维度裂缝，为这场宇宙史诗埋下最后的伏笔……