丰缘地区，有自然与科学相互融合之城称号的卡那兹市，一个名叫雨轩的少年天才，正以他雄厚的背景，传奇的经历以及对宝可梦的独特理解和研究而崭露头角。
雨轩的父亲木槿是一位成功的企业家，经营着一家名为“得文制造”的公司。他对雨轩的研究抱有浓厚的兴趣，并且在资金和资源上给予了极大的支持。他相信，雨轩的研究将为家族企业带来新的发展机遇。
雨轩的兄长大吾是联盟冠军，他以使用钢系宝可梦而闻名。他对雨轩的选择表示支持，并且经常在训练和比赛中与雨轩分享他的经验和技巧。他相信，雨轩有朝一日也能成为像他一样优秀的宝可梦训练师。
有父亲与兄长的背景，雨轩妥妥的富二代，还得是钻石级别的，按理说享受奢靡生活就好了，可雨轩却努力的出奇。
受大吾的影响，雨轩的目标是成为一名顶级宝可梦训练师。梦想超越其兄长，联盟冠军大吾，登上最强的位置。他相信，只有不断地学习和进步，才能达到这个目标。同时，他也希望能够解开更多关于宝可梦的奥秘，为宝可梦世界的发展做出自己的贡献。
雨轩从小就对宝可梦产生了浓厚的兴趣，不仅阅读了大量的宝可梦相关书籍，还经常到郊外的森林和草原中实地观察宝可梦的行为模式。十五岁时成为宝可梦学者，并取得一定的成就。
在一次偶然的机会中，雨轩得知了一个古老宝可梦遗迹的消息，据说那里隐藏着关于宝可梦起源的秘密。他决定组织一次探险队，前往这个遗迹进行探索。在探险过程中，他们遭遇了前所未有的危险，一只强大的裂空座和代欧奇希斯正在遗迹附近进行激烈的战斗。
雨轩的探险队试图避开这场战斗，但不幸的是，他们被战斗的余波波及，雨轩在这次意外中受到了严重的伤害，陷入了昏迷，同时，轩遗迹中，未知的神秘能量携着一个微弱的灵魂，突然融入了他的身体……
昏迷一年来，一直没什么好转，为了维持其几近崩溃的意识，只好用超能系宝可梦，用念力为其梳理维持，效果却寥寥无几，最终为了治疗，使用了多数人接触不到的禁忌，基因药剂！
此药剂自于关东地区一个黑暗组织，火箭队，据说是未知的超能系神兽宝可梦的基因产物。一名火箭队干部，用此药剂换取了大量的资源与一部分技术资料,后续会有提及,暂且不提。
神兽的力量何其强大，岂是凡人之躯可以承载的，何况雨轩更是重伤的情况，无疑是雪上加霜。最终结果就是，雨轩脑死亡……
与此同时，蛰伏其身体的神秘能量接管了身体，一个微弱的意识正在吸取雨轩那破碎且凌乱的记忆，逐渐开始清醒。
“这里是哪里……我是谁？……宝可梦世界？兹伏奇家族次子……雨轩……这具身体的名字吗？我这是穿越了？还是借尸还魂了？……算了，既然霸占了你的身体，吸收了你的记忆，那此世，就带着你那一份一起努力吧……”
雨轩此时努力的整理着记忆，自己本是蓝星一位三十多岁的社畜，没什么追求，喜欢二次元，各种动漫游戏，性格有些偏执（玩宝可梦游戏，喜欢的宝可梦必须抓到，必须刷到金色资质，最起码得是5V高个体值)。
明白自身处境后，神经大条的他很快接受了穿越重生的事实，并对现在的身份表示十分满意，妥妥的天胡开局，宝可梦世界，号称万千穿越者最向往的世界，也是最安全的世界。
强悍的真新人体质，各种光怪陆离的超能力，（常磐之力，御龙之力，超克之力，超能力……)以及令人无法拒绝的宝可梦，还要啥自行车啊，另外就这身份背景，只要不作死，够锦衣玉食，无忧无虑的活到死，雨轩表示很满意……
穿越者必有金手指啊，雨轩获得的是一个可以成长的小型世界，可以收录物品，宝可梦也可以生活其中，随身小世界的既视感，对此雨轩的天国种田基因瞬间觉醒，在小世界里种满各类树果和一些特色植物，乐此不疲……
经过三个月的休养，雨轩的身体，一年多的昏迷造成的肌肉萎缩等症状全部恢复 ，并且还获得了一种全新的能力——他能够与宝可梦进行心灵感应，直接理解它们的感受和需求（超能力觉醒，来自基因药剂)。
他开始尝试用这种能力与他的宝可梦伙伴沟通，结果令人惊讶，他的宝可梦们在他的引导下，表现出了前所未有的配合和力量。
在修养和锻炼能力期间， 雨轩结合蓝星关于宝可梦的记忆，发表了数篇论文。研究重点是宝可梦的进化机制，他认为宝可梦的进化不仅仅是力量的积累，更可能是与环境的互动和内在潜力的激发。
雨轩提出了两种种新的理论，即“环境触发进化”（草精灵，冰精灵)，‘携带道具进化’（大岩蛇，飞天螳螂，铁甲暴龙，鸭嘴火龙，电击兽等)，并开始设计实验来验证他的想法。
过程虽然有些波折（制造道具的材料问题)，却都得到了验证，成功进化出新的宝可梦形态。这一结果，在宝可梦研究界掀起轩然大波，众多宝可梦博士纷纷响应，让雨轩的声望一时无两，被联盟赐予博士称号。
而得文制造公司也在此事件中赚的盆满钵满（制造道具，对于材料和技术的垄断)，以此与联盟交易，获得了大量的利益。
随着时间的推移，虽然研究成果完全转化成为宝可梦训练家的实力，有些困难（联盟掌控，想分一杯羹)，但是雨轩的名字在宝可梦训练师中越来越响亮。
他的故事激励着更多的人去追求自己的梦想，去探索未知的奥秘。而雨轩本人，也将继续他的旅程，用他的勇气和智慧，书写着属于他的传奇……
他决定出发去旅行，邂逅更多伙伴，更加了解这个世界。家人的支持给了雨轩很大的信心，他希望通过自己的努力实现梦想……