戚继光和李成梁在收拾土蛮部的时候，朱载坖也在文华殿处理政务，从这次朱载坖回来之后，给太子以更大的权力，一些庶务直接由太子决定，朱载坖只负责处理军国大事和重要的人事任免活动还有对外的各种交往和官军的各种事务。
对于朱翊釴的行政能力，朱载坖还是很满意的，但是朱翊釴确实还没有建立起足够的威望，这个问题确实困扰着朱载坖，他的讲官们中，如申时行等人本就不是性格很强势的人，王锡爵倒是有点强势，可惜现在在倭国，等风头过去再说，这些讲官们也影响了朱翊釴的性格，导致朱翊釴的性格颇为稳重，但是不够强势，这是朱载坖所担心的事情。
于是朱载坖找来了少府卿严世蕃，和他商量这个问题，朱载坖担心的是他以后驾驭不了这些臣子，对于这个问题，严世蕃倒是没有这么担心，严世蕃认为事情倒远远没有这么严重，太子虽然有些文弱，但是加以历练还是能够成为合格的皇帝的，至于这么对付言官，那还不简单，庭杖、诏狱，厂卫，怎么开心怎么来呗。
但是朱载坖仍旧不放心，性格好对于普通人来说是加分项，但是对于皇帝来说就未必是，大明的这些官员，蹬鼻子上脸的多了去了，对于这些人，朱载坖很清楚不能给他们好脸色，现在朱翊釴就是脸皮太薄，不知道应该怎么对付他们，在和严世蕃商量之后，朱载坖决定将都察院交给朱翊釴，朱载坖明发上谕，嗣后都察院的奏疏，由太子先处理了之后再由朱载坖处理，同时为太子刻了出太子印玺之外的一方私印，也就是禹斋，因为世宗皇帝的私印是尧斋，而朱载坖的私印是舜斋，朱翊釴的私印自然就是禹斋了。
将这群疯狗直接交给朱翊釴来处理，对于都察院奏报的各种事情，尤其是弹章，朱翊釴先过目处理，朱翊釴无法处理的朱载坖再来处理，先让朱翊釴见识见识大明言官的威力，在朝廷的各种奏疏之中，尤其以都察院和六科的奏疏最多，因为他们是负责骂人的部门，职业的，都察院和六科的奏疏能够占到整个大明朝廷奏疏的一半，这还是在朱载坖严厉整顿，禁止风闻言事之后了，现在的都察院权力依旧很大，对于各级衙门的账目、行政都有权进行审核并且予以弹劾。
所以当朱载坖的的命令下达之后，顿时就在都察院引起了波澜，这些言官们纷纷上疏，认为朱载坖这么做不和大明体例，虽然朱翊釴是太子，但是即便是太子，也只有在皇帝出巡的时候有监国，但是从没有听说皇帝就在京师，而让太子处理政务还专门下旨由太子负责都察院事务的事情，他们纷纷上疏要求恢复旧制。
朱翊釴拿着这些奏疏问朱载坖：“父皇，言官们都说不可啊。”
朱载坖笑着说道：“这些奏疏，现在由你来处理，朕二十年来，所为之事，他们说不可的多了，但是朕不是一样做了吗？既然由你负责，就由你批答这些奏疏。”
朱翊釴无奈，只的在上面批答道：“揽奏已送御批。”但是朱载坖的态度是直接留中不发，根本不予理睬，对于闹得厉害的，直接予以处分，御史们则采取另一种办法，弹劾阁臣、都御史们不作为，御史们弹劾重臣，朱翊釴不敢处置，送朱载坖这里，朱载坖仍旧说道：“现在既然叫你处理都察院的奏疏，就由你负责，你尚且没有意见，朕做何批？”
朱翊釴于是在御史们的奏疏上批道：“事干重臣，岂可妄议。”朱载坖对于朱翊釴的批答只有一个字，可，放手让朱翊釴负责处理，最近对于朱翊釴来说确实是很难过，处理政务远比处理都察院这些破事要轻松多了，政务都是有据可查的东西，但是都察院这些御史们，今天弹劾这个，明天弹劾那个，往往是抓到一点东西就大做文章，反正御史弹劾不受处罚嘛，你说他胡乱言事，都也不完全是，毕竟真的是胡乱上奏渎扰，朱载坖肯定不会放过他们的，但是往往是夸大其词或者借题发挥，这些都是大明言官的基操了。
朱翊釴对于都察院的这些奏疏是极为不满的，朱载坖笑着说道：“你现在知道大明的这些官员是些什么货色了吧？”不是所有人都和讲官们一样温文尔雅，有凭有据的，这些人东拉西扯，到处惹是生非，都是从常态了。
朱载坖问道：“知道这些言官的作用吗？”
朱翊釴说道：“儿臣知道，他们是朝廷和陛下的耳目。”
朱载坖笑了笑说道：“耳目？他们算什么朝廷的耳目，朝廷要是真的指望他们当朝廷的耳目，那朝廷就真的是聋子、瞎子了。”
朱载坖很清楚，这些御史们很多时候都已经是重臣们斗争的工具了，虽然朱载坖已经竭力予以整顿了，都察院也基本回到了监察机关的职能上来了，但是他们所能够发挥的耳目作用其实是很有限，朝廷御史即便是在朱载坖扩大之后，不过四百余，一半在地方巡视，也就是二百余，他们就算是各个都精明强干，忠于朝廷，所能看到的也不过是两百余州县的情况，对于大明来说，有类管中窥豹。
朱翊釴有些不解，那御史的作用是什么呢？朱载坖认为，御史的作用主要有两个，第一是对于地方官员和朝廷重臣的监督，有了这些御史的弹章，朝廷也许现在不会处理你，但是只要皇帝想处理哪个官员，这些弹章就是处理的依据，朱载坖很清楚，虽然朱载坖提高官员待遇，不准官员雇佣师爷、幕僚，甚至将贪墨以重罪惩罚，都察院也严厉整顿贪墨，但是要想彻底禁绝贪墨，显然是不现实的，总有朝廷看不到的地方，但是这些巡按御史的巡察，如果能够使得这些贪官污吏收敛一点，对于朱载坖来说就已经是很不错了。