和王崇古谈完之后，朱载坖开始安排自己的事情了，仅仅听张居正、王崇古汇报是不够，朱载坖除了令厂卫收集有关新政的得失情况之外，还下令东南各州县官员都可以就新政得失向朱载坖直接上疏，朱载坖不以言罪人。
除此之外，朱载坖还将自己随驾的几位翰林官都派出去巡视地方，收集相关的情况，王锡爵去浙江，许国去苏松常镇，申时行去凤阳淮安等府，以钦差的名义，查看地方民情和州县官员理政得失。
朱载坖自己也很清楚，新政不可能是尽善尽美的，肯定是有各种缺陷，朱载坖要做的就是尽可能的收集各方面的意见，减少新政的弊端。
除此之外，朱载坖就是要帮张居正解决南京勋臣这个问题。朱载坖召集魏国公、恭顺侯等人来，一来是询问南京守备的情况，二就是要求这些勋臣们配合新政，尤其是配合张居正清丈田亩。
朱载坖首先就是向现任南京守备恭顺侯吴继爵询问南京京营的情况，吴继爵作为长期出镇地方的勋臣武将，对于南京京营，吴继爵是一脸无奈，和京师京营一样，只不过南京京营的问题更加严重，士卒逃亡，勋臣军官役使军士，军器甲胄丢失，京营操练不勤，而且留在京营的士卒多是老弱，根本不堪上阵。
吴继爵作为当过辽东总兵，见识过蓟辽河宣大精锐的人，对于南京京营，吴继爵实在是看不上，直接向朱载坖坦陈南京京营根本不能上阵，除了徒耗粮饷之外，别无他用。
吴继爵的指责已经是非常之重了，其实朱载坖也很清楚为什么吴继爵要痛陈南京京营的各种不堪来，主要是要让魏国公徐鹏举这个草包下不来台，毕竟吴继爵才刚刚上任，这些事情肯定是由徐鹏举这个长期担任南京守备的草包来承担了。
谁叫你徐鹏举公开说吴继爵是降虏之后的，吴继爵当然要还以颜色了，朱载坖当即发作道：“南京乃大明之留都，太祖陵寝之所在，防守宜严，昔年数十倭寇，震动南京，当年旧事若在再重演，尔等之钟鸣鼎食，自此绝矣！”
朱载坖天子一怒，吓得南京勋臣们赶紧跪下请罪，尤其是徐鹏举，他很清楚，吴继爵说的桩桩件件都和自己有关，一旦朱载坖震怒之下严查，自己肯定是讨不了好果子吃的。
徐鹏举赶紧请罪说道：“臣有罪，臣有罪，请陛下治罪。”
朱载坖问道：“魏国公何罪之有。”
徐鹏举说道：“陛下，臣和临淮侯长期担任南京守备，南京京营涣散，臣罪当诛。”
此言一出，朱载坖不得刷新了对于徐鹏举的看法，他不是个草包，而是大大草包，徐鹏举认为之前临淮侯李庭竹也担任过南京守备，所以想拉李庭竹一道背锅，但是徐鹏举显然忘了一个问题，李庭竹和朱载坖的关系比之他徐鹏举可是要亲近多了。
虽然徐鹏举是世袭的魏国公，大明的第一勋臣，但是从和皇帝的亲近程度来说，他徐鹏举是远远比不上李庭竹的，魏国公和皇室关系最近也就是在成祖和仁宗的时候，毕竟成祖娶的中山王徐达的女儿徐皇后，仁宗更是徐皇后嫡子，和皇室的关系很亲近，但是就是在这个时候，魏国公和皇室的关系也并不亲密，远远不如定国公。
由于徐辉祖在靖难中的态度，魏国公一向不受成祖待见，后来的皇帝就更加的关系疏远了。
而李庭竹出身于曹国公家，岐阳王李文忠是太祖的外甥，和皇室是极为亲近的，而朱载坖的李皇后也是出身于临淮侯家，朱载坖和李庭竹之间的关系自然是十分的亲近，徐鹏举想把李庭竹一道拉来顶缸，显然是极为愚蠢的事情。
朱载坖内心都是很无奈，他知道徐鹏举草包，没想到徐鹏举如此草包，什么话该说，什么话不该说都不知道。
和朱载坖一起接见勋臣的高拱立马反应过来，当即厉声呵斥道：“魏国公，你自己在南京守备任上有疏漏就罢了，与临淮侯何干？”
徐鹏举当然也知道自己说错了话，赶紧磕头请罪道：“臣有罪！”
朱载坖对于这位草包国公实在是无可奈何了，只得说道：“魏国公，朕记得之前就有人弹劾过你役使士卒吧？”
要说这南京城内哪一家勋贵役使的士卒最多，肯定就是魏国公徐家了，魏国公号称大明第一勋臣，虽然在政治上没有什么权力，但是在地位上还是尊崇的。但是之前南京兵部职方司主事吴逵弹劾徐鹏举私自役使军士，擅役营卒，朝廷派御史清查，竟有数千人之多，可见魏国公一家役使军士数量之多。
气的当时徐鹏举还无能狂怒了一番，徐鹏举公开放出话来：我拼一铁券杀吴某如猫搏鼠耳！
想要恐吓吴逵，没想到吴逵早就早就看透了徐鹏举的草包本色，根本不为所动，徐鹏举也只得就此罢休，现在朱载坖以天子之尊，亲自问起此事。
徐鹏举一下子汗流浃背，说话都有些结巴了，朱载坖不禁无奈，想当年中山王徐达何等样风采？要是知道徐鹏举是这般草包，不得气的从坟里跳出来抽他。
朱载坖说道：“魏国公，有就是有，没有就是没有，朕不至于因为这个就夺爵的。”
徐鹏举跪在地上垂着头说道：“回陛下，是有的。”
朱载坖说道：“这些事情，朕早就知道了，但是你们都是勋臣，是朕最信得过的人，你们是和大明与国同休的臣子，按说朕不该整日里盯着你们。但是现在朕不得不拿你们开刀了，私自役使的军士，你魏国公要做个表率，清退回营操练。”
徐鹏举赶紧说道：“臣领旨！”
朱载坖接着问道：“朕听说你对新政很抵触，是不是真的？”
朱载坖问到这个问题，徐鹏举就已经知道朱载坖要说什么了。