刘长风本就计划利用神龙教内部叛乱的机会，通过比武的形式赢了洪安通，最终取代洪安通成为神龙教的教主。如今当真如愿以偿。
他之所以选择神龙教，是因为神龙教内部已经不团结了，仅仅因为洪安通的武功高强，勉强压制着，君不见韦小宝那种无知的痞子样儿，陆高轩都建议推举他做教主，虽然口不对心，完全有可能过河拆桥，但是也足以说明神龙教内部已经混乱不堪，急需先行推翻洪安通，再说其它。如果有人以强大的武力打败洪安通，震慑神龙教群雄，完全有机会入主神龙教，并彻底收服众人。毫无以为，刘长风成功了！
在做了教主以后，他才惊喜地发现，选择神龙教，利用神龙教的势力，果真是最佳的反清途径，因为他作为神龙教教主，知道了原来前世不知道的秘密，总结起来，神龙教有下面几个大的优势：
其一，神龙教高手如云，随便拉出一个高层人物都能和中原的绝顶高手相抗衡，而且之前行动十分隐秘，世人知道其底细的并不多，以天地会的能量，居然也只能知道一些表面的皮毛。人常说“闷声才能发大财”，以这股神秘而又强大的力量，在出其不意的情况下，很容易获得极大的成功；
其二，神龙教在中原各个势力中都安插了人手，除了毛东珠在清宫中假扮皇太后，也有人在平西王府潜伏，有人在少林寺中潜伏，甚至连天地会都有神龙教的奸细。又因为沐王府的崛起，洪安通也开始着手准备安插沐王府的奸细，这让刘长风一身冷汗，直感叹这一步棋确实走对了；
其三，孤悬海外，岛上毒蛇纵横，若是没有神龙教自己的药物，任何人上岛都要吃亏。不容易攻破。同时地理优越，靠近朝鲜国，可谓是进可攻取中原，退可移居海外，原着中若不是韦小宝深知神龙岛底细，以迅雷不及掩耳之势炮轰神龙岛，神龙教是否就此衰败，还真是难说。
可以说，神龙岛同时拥有恐怖的武力值，强大的情报网，绝佳的地理环境三大因素。原着中，洪安通硬生生将这一副“王炸牌”打成了“绿帽王”，最后还被奸夫用自己传授的武功杀死，也真是无能至极。
刘长风初次入主神龙教，必须得安抚众人的情绪，维持神龙教的稳定。于是他做了很多改变和安排：
第一，刘长风下令软禁苏荃，苏荃作为毒害教内老兄弟的主犯或是说重要帮凶，自然不能轻易放过，然后逼迫她交出豹胎易筋丸的解药。其实不用苏荃给出解药，刘长风也有办法，不要忘了他有胡青牛的《医经》和王难姑的《毒经》，在这两本奇书面前，豹胎易筋丸也只是个狠毒而又低级毒药。刘长风这个举动，果然是得到神龙教的教众拥护。均心想不愧是素有侠名的大汉剑神，从此自己再也不用提心吊胆了。
第二，拜见刘长风时，禁止喊那些类如“寿与天齐”等马屁口号，长时间被吹捧多了，再谦虚谨慎的人都会变得自大虚荣，甚至变得像洪安通一般失去理智。
第三，废除“猪尾巴”式的头型，男子开始蓄发，并恢复前明服饰装扮和交往礼节。潜伏中原的奸细暂时保持原来的服饰和习惯。
第四，神龙教教徒不得为恶江湖，教内必须相互友爱帮助，不得勾心斗角，阴谋教友。
第五，叛教者，或是未经教主允许脱离神龙教的教众，阖教上下可群起而攻之，千里追杀，不死不休！没了豹胎易筋丸的约束，刘长风自然要设置这么一条教规，以防有异心之人。
第六，神龙教的白龙门龙使由教内一个叫孙海英的人担任，此人是明末抗金（后金，满清前期的称号）英雄孙承宗的后人，一手家传刀法的威力不亚于五龙使。因心直口快被洪安通关押了三年之久。刘长风得知了他的情况后，马上名人释放孙海英，经过一番交谈，决定让他担任白龙使。
第七，神龙教的赤、青、黑、白、黄五大龙门按战场军阵的方法操练门下教徒，赤龙门、青龙门和黄龙门负责陆地作战，黑龙门和白龙负责海上作战。其实五大龙使不仅仅是武林高手，而且都曾在不同时期和不同阵营参加过对清的战争，这个正对刘长风下怀，反清这种伟大的事业，最好是在战场上解决的，一味练习武艺自然是不行的。在与五大龙使交谈时，刘长风用前世先进的军事理念忽悠的五龙使一愣一愣的，他们这才彻底认可刘长风，认为这样的文武全才，才是最适合做他们教主的。
随后，刘长风又加设了紫龙门、火龙门和金龙门。
紫龙门，负责情报搜索和管理。也就是说，那些在各个门派中的间谍，都归之于紫龙门门下，刘长风觉得这样统一管理，能够更好的管理情报。紫龙门的龙使由陆高轩担任。
陆高轩此人不是一般的江湖中人，他出身于山西的一个书香门第家庭，先祖父、祖父和父亲都是明朝的高官，而且陆家人学识深厚，颇有名望。满清入关后，极力拉拢陆家，可是偏偏陆高轩的父亲，当时的陆家家主正气凛然，不愿意向蛮夷低头。
因此，陆家自然受到满清朝廷的重点“照顾”，上到耄耋老人，下到无知孩童，均被杀害。当时的陆高轩才15岁，陆高轩能够逃脱，是因为一个忠心的老仆将自家的孩儿顶替了陆高轩。
陆高轩虽然保住了性命，但从此流落江湖。幸运的是，他的武学根骨被一位高人看上，做了这名高人的衣钵弟子。二十年后，陆高轩以一手出神入化的判官笔威震山西。
后来受到神龙教的招揽，加入了神龙教，因为陆高轩文武双全，并酷爱药理，因此掌管神龙教的药房，当然除了豹胎易筋丸这类的药物之外。