第五节 细菌的分类与命名
1.细菌分类地位
1.1 分类地位：原核生物界
1.2 分类单元：
1细菌分类的层次与其他生物相同，也是界、门、纲、目、科、属、种。
2在细菌种，常用属和种。
1.2.1
属：
1生物学性状相近、关系密切的若干菌种组成一个菌属。
2具有共性的若干种的组合，应与其他属有明显的差异。
3不同属之间的 16S rRNA 序列有较大的差异，但目前尚无量化标准。
1.2.2
种：
1细菌分类的基本单位。生物学性状基本相同的细菌群体构成一个菌种。
2同一菌种的各个细菌，虽性状基本相同，但在某些方面仍有一定差异。
3亚种：同一菌种各个细菌，某些方面仍有一定的差异，可再分成亚种。
型：
1“型”常用于亚种以下的细分。
2是同种之间在某些特殊性质上有区别的细菌。它们之间的区别不像亚种那样显着。
3按抗原结构的不同，可将细菌分成多种不同的血清型。
1.2.3 菌株：
1人们把不同地区或不同实验室分离到的具体菌种称为菌株。
2一旦菌株发生变异，均应标上新的菌株名称。
3当进行菌种保藏，筛选或科学研究时，在进行学术交流或发表论文时，在利用菌种进行生产时，都必须同时表明该菌种及菌株名称。如：dh5a 菌株、bL21（dE3）菌株等。
2.细菌的命名
1命名原则：据国际细菌的命名法规，采用拉丁文双名法。
2每个菌名由两个拉丁字组成。前一字为属名，用名词，第一个字母大写后一字为种名，形容词，第一个字母小写。
3一般属名表示细菌的形态或发现或有贡献者，种名表明细菌的性状特征、寄居部位或所致疾病等。
4整个属名和种名在出版物中应排成斜体。
5中文的命名次序与拉丁文相反，是种名在前，属名在后
eg： Staphylococcus aureus（属名 种名）
金黄色葡萄 球菌（种名 属名）
Escherichia coli（属名 种名）
大肠埃希菌（种名 属名）
3.细菌分类鉴定的标准
1按表型特征分类法（陈旧培养基会使性状发生改变）。
2种系发生关系鉴定
（1）测定 dNA 中（G+c）mol%
（2）核酸杂交法
（3）16s RNA 寡聚核苷酸序列
4.细菌的分类方法：
1条目分类法
2数值分类法
5.细菌的分类体系
1《伯吉氏系统学手册》
2《原核生物》
3国际系统与进化微生物学杂志（IJSEm）。
4国际着名的菌种保藏机构。
6.细菌的鉴定
1先获得细菌纯培养物，明确其是否具有致病性，若是致病菌及时做药物敏感试验。
2鉴定一般采用形态学观察作初步鉴定，含革兰染色，荚膜，鞭毛，运动性观察等。
3然后进行生化试验、血清学试验作进一步鉴定。
4也可进行 16S rRNA 序列扩增测序，将测到的序列与 Genbank 中已知的细菌序列相比较，根据亲缘关系远近最终确定种属。一般来说，90%以上的同源性就可确定到属，确定到种的可能性很小。
病料采集 （涂片、染色、镜检）
↓
分离培养（观察培养特征、涂片、染色、镜检）
↓
纯培养
↓
动物试验（药感试验、培养特性、生化试验、血清学试验、分子生物学方法）
第六章 革兰阳性球菌
球菌种类
按革兰染色特性分为：1革兰阳性球菌 2革兰阴性球菌
兽医临床上重要的是革兰阳性球菌。
其中葡萄球菌属（产物有些引起中毒）和链球菌属的某些成员是人和动物的重要致病菌。
第一节 葡萄球菌属
一、概述
二、生物学性状
三、分类（记住某一种菌哪一血清型对动物有致病性，猪瘟病毒就一个血清型）
四、致病性（最重要！掌握其导致什么疾病）及毒力因子
基本思路：某一病→哪一类可能致此病→联系部位→进一步诊断
↓
分细菌和病毒，思考细菌和病毒各有几类可至此病。
需掌握：此类病毒有一个还是多个血清型，哪些比较常见或对动物致病性强，
→哪一种型疫苗进行防治
五、微生物学诊断
1疾病菌核酸测序：测序系列与病原系列进行比对→同源性高才可以做进一步鉴定。
2掌握每个病毒最主要的病毒因子，及哪些致病集团+相关蛋白。
1.概述
1葡萄球菌属是一群革兰氏阳性球菌，因常堆聚成葡萄串状，故名。
2葡萄球菌分布广。
3多数为非致病菌，少数可导致疾病。
致病性葡萄球菌常引起各种化脓性疾患、败血症或脓毒败血症。
当污染食品时，可引起食物中毒。
考：葡萄球菌主要引起什么疾病
2.生物学性状
1形态染色
2培养特性
3生化反应
4抗原结构
5抵抗力
2.1 形态染色
1典型的葡萄球菌为圆形，直径 0.5~1.5um，排列成葡萄串状。
2在脓汁中或生长在液体培养基中的球菌常呈双球或短链排列。
3无芽孢、无鞭毛，有的形成荚膜或黏液层。
4革兰染色：革兰阳性，但衰老、死亡或被白细胞吞噬以及耐青霉素的菌株呈阴性，无运动力。
2.2 培养特性
营养需要（高还是低）
1营养要求不高：在普通培养基上生长良好。
在含有血液和葡萄糖的培养基中生长更佳。
2不在麦康凯培养基生长
培养特性
1营养需要
2呼吸类型
需氧或兼性厌氧
3温度 （没有特殊不用记，一般与宿主体温一致）
28~40c均能生长
致病菌最适温度为 37c
4酸碱度
ph 为 4.5~9.8
最适 ph 为 7.0~7.5
5在培养基中的生长现象
在肉汤培养基中 24 小时后呈均匀混浊生长在琼脂平板上
菌落 圆形凸起，边缘整齐，光滑，湿润，不透明
色素 （1）脂溶性。不同种的菌株产生不同的色素
（记） 如金黄色、白色、柠檬色
（2）致病性菌株多能产生脂溶性的黄色或柠檬酸色素，不着染培养基
如何判断不溶于水\/脂溶性：只有菌落有颜色，培养基无
在血琼脂平板上（掌握颜色+是否溶血）
菌落 形成的菌落较大
溶血 有的菌株菌落周围形成明显的全透明溶血环
（β溶血），也有不发生溶血者
凡溶血性菌株大多具有致病性