清初的水师是继承了明朝水师的传统编制的，所以体制是完备的，而且职责明确，赏罚分明，形成了非常良性的一个循环。
话说当时满清入关后，继续南下，各地残余的明军和农民起义都是被逐步瓦解。在东南沿海亦商亦盗独霸一方的郑芝龙最后也是投降了清朝，而且当时郑芝龙手下有水师20万，虽然这些大部分有海盗性质，但是水师作战实力相当厉害。
从这之后清朝对沿海地区的作战顺风顺水，节节胜利，靠的就是郑芝龙的水师。
郑芝龙时代过去之后，施琅上线，施琅以前就是郑芝龙的手下，所以他的水师统领水平也非常的高。最后率军2万终于把郑氏集团打得归顺到了清朝了。
晚清时期，清军组建了北洋、南洋、福建、广东四大水师。其中福建水师的战舰基本都来自福建船厂，是洋务运动多年的心血。然而这支倾注无数心血的水师却如昙花一现，其覆灭的速度快到难以想象。
水师提督是清朝独有的，其它朝代没有，水师提督其实就是“从一品”了。清朝水师提督是武职类的官名，全称叫提督军务总兵官，水师提督管辖一个省的水路官兵，是各省绿营最高主管官，可以说是封疆大吏，掌管的范围一到两个省，数万平方公里到十万平方公里。
话说赖明峰入伍之后，仕途可谓顺风顺水。一般来说，水师入伍，晋升的通道还是很畅通的，从水兵开始，到把总，然后千总，后升守备、参将、总兵，最后就是水师提督。清朝时期有3名水师提督，分别是福建水师提督、广东水师提督、长江水师提督。话说在清末还有一个全新的新式海军，南洋水师也叫南洋海军，主要的责任是负责江浙一带的海防事务。实力也是不容小觑。
在国人眼中，近代以来，由于国力衰败，中国海军也往往处于忍气吞声的地位。其实，孱弱的近代中国海军也并非无所作为，在国家危难之际，它尽其所能与列强海军周旋，以最大力量维护民族尊严，在历史上留下了为数不多的几个闪光点。
大清水师也曾很强大，在历史上留下了为数不多的几个闪光点
北洋水师首访日本赢得谈判
1886年，日本、英国、俄国势力渗入朝鲜，为争夺控制权展开了激烈的争斗。作为朝鲜保护国的清朝，深知一旦朝鲜旁落他人之手必将危及自身安全，于是命令北洋水师“定远”、“镇远”、“济远”、“威远”、“超勇”、“扬威”等6艘军舰前往朝鲜东海岸海面操演，借以展示清政府强大的海军实力，威慑敌国勿要轻举妄动。
是年8月1日，“定远”、“镇远”、“济远”和“威远”4艘军舰在丁汝昌的率领下，奉命前往日本长崎港进行大修。8月1 5日，数百名放假的水兵上岸观光。当水兵行至广马场外租界和华侨居住区一带时，数百名早有准备的日本警察将街道两头堵死，将手无寸铁的中国水兵隔离存各个街区，随即大肆挥刀砍杀。长崎市民在歹徒煽动下从楼上往下浇沸水、掷石块，甚至有人手拿刀棍参与混战。中国水兵猝不及防，又无法互相呼应，结果吃了大亏，死亡5人，重伤6人，轻伤38人，失踪5人。
事件发生后，中日双方进行了长达几个月的谈判，日方起初不肯让步，谈判一时陷入僵局。中方有人提出“撤使绝交、以兵相胁”的主张，海军实力不济的日方慑于北洋水师的强大武力，这才在英、德公使的调停下，在1887年2月与中方达成协议，对死伤者各给抚恤。
北洋水师首访日本最终以日方屈服而终结，但日本民间的复仇情绪被煽动起来，大受刺激的日本政府投入巨资建设海军，从天皇到百姓踊跃捐款购置军舰，力争短期内赶超北洋水师。
震慑古墨的跨洋航行
甲午战败后，清朝的国际地位一落千丈，简直沦落到人尽可欺的地步。1905年，美国议会在白人工会的压力下，强行通过了禁止华工的法令。清政府驻美公使伍廷芳据理力争，始终未能挽回局面。墨西哥议会趁火打劫，也提出了禁止华工入境的法令。伍廷芳受命与墨西哥政府进行谈判，结果碰了一鼻子灰。伍廷芳拍案而起，勃然怒喝:“下旗!回国!电中国政府，派兵船来，再和你们周旋!”此言一出，墨西哥官员目瞪口呆，第二天的报纸纷纷将清政府的“炮舰外交”作为头条新闻，还配发了中国海军巡洋舰破浪航行的照片。墨西哥震惊之余，赶紧请美国政府调停，最后以废除禁止华工入境法令而告终。
原来，清政府败于日本后痛定思痛，不惜重金重建海军，从英国、德国购入“海天”、“海圻”、“海容”，“海筹”等巡洋舰，建立了巡洋、长江两支舰队。虽然实力不能与当年的北洋水师相提并论，但还是远远超过了墨西哥海军。受此事件启发，1908年，清政府下令萨镇冰率领“海圻”、“海容”二舰前往新加坡、印尼、越南等地抚慰南洋侨胞，开启了近代中国政府宣抚华侨的始端。
日制军舰访问仇家
1934年5月30日，日本海军元帅东乡平八郎死去，日本邀请各国海军首长参加东乡的葬礼，鉴于当时中日关系日趋紧张，大战一触即发，中国政府最后派出了海军第一舰队“宁海”号巡洋舰，代表军方而非政府前往日本访问。
应该说，这次访日极具讽刺意味:一方面，东乡平八郎在甲午战争中，率领“浪速”号等3艘日舰在丰岛击沉了中国运兵船“高升”号，致使900多名清军官兵葬身大海，另一方面，民国政府由于资金有限，只能用招标方式购买军舰，而“宁海”号的生产商日本播磨船厂报价低廉，并同意用东北大豆折价，结果中了标。于是，就出现了中国海军派出日制军舰访问仇家日本的现象。
尽管日本之行有屈辱的成分在内，但中国海军官兵有礼有节，不卑不亢，以严整的军容和严格的军纪赢得了日本友好人士的尊重，以有素的军事训练和良好的装备保养展现了中国自强不可欺的军威。
有诗为证：
日夜卫海疆.
艨艟巨舰巡国界，定远号上龙旗妍.
旅顺威海龙虎距，舳舻千里锁雄关.
甲午风烟蔽华夏，视死如归赴国难.
东沟洋面天如墨，火光熊熊浪滔天.
军中将士多豪杰，世昌独将鳌头占.
临危不惧亲发炮，舍身报国撞日舰.
只缘清廷多孱弱，报国壮志难完现
力战捐躯亦无奈，亚洲第一终覆亡
新式海军由此创，铁血男儿丛中塑.
风自刘公吹浪去，涛声依旧浪淘沙.